Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TEAD2
Ідентифікатори
Символи
TEAD2 , ETF, TEAD-2, TEF-4, TEF4, TEA domain transcription factor 2
Зовнішні ІД
OMIM : 601729 MGI: 104904 HomoloGene: 19662 GeneCards: TEAD2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • sequence-specific DNA binding • transcription coactivator binding • protein heterodimerization activity • disordered domain specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • hippo signaling • transcription, DNA-templated • васкулогенез • embryonic heart tube morphogenesis • regulation of stem cell differentiation • notochord development • negative regulation of cell death • neural tube closure • paraxial mesoderm development • lateral mesoderm development • cellular response to retinoic acid • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic organ development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 49.34 – 49.36 Mb
Хр. 7: 44.87 – 44.88 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TEAD2 (англ. TEA domain transcription factor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 447 амінокислот , а молекулярна маса — 49 243[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGEPRAGAAL DDGSGWTGSE EGSEEGTGGS EGAGGDGGPD AEGVWSPDIE
QSFQEALAIY PPCGRRKIIL SDEGKMYGRN ELIARYIKLR TGKTRTRKQV
SSHIQVLARR KSREIQSKLK DQVSKDKAFQ TMATMSSAQL ISAPSLQAKL
GPTGPQASEL FQFWSGGSGP PWNVPDVKPF SQTPFTLSLT PPSTDLPGYE
PPQALSPLPP PTPSPPAWQA RGLGTARLQL VEFSAFVEPP DAVDSYQRHL
FVHISQHCPS PGAPPLESVD VRQIYDKFPE KKGGLRELYD RGPPHAFFLV
KFWADLNWGP SGEEAGAGGS ISSGGFYGVS SQYESLEHMT LTCSSKVCSF
GKQVVEKVET ERAQLEDGRF VYRLLRSPMC EYLVNFLHKL RQLPERYMMN
SVLENFTILQ VVTNRDTQEL LLCTAYVFEV STSERGAQHH IYRLVRD
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Jacquemin P., Hwang J.-J., Martial J.A., Dolle P., Davidson I. (1996). A novel family of developmentally regulated mammalian transcription factors containing the TEA/ATTS DNA binding domain. J. Biol. Chem . 271 : 21775—21785. PMID 8702974 DOI :10.1074/jbc.271.36.21775
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші