Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MEIS1
Ідентифікатори
Символи
MEIS1 , Meis homeobox 1
Зовнішні ІД
OMIM : 601739 MGI: 104717 HomoloGene: 135741 GeneCards: MEIS1
Пов'язані генетичні захворювання
синдром неспокійних ніг [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• megakaryocyte development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • negative regulation of neuron differentiation • locomotory behavior • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • lens morphogenesis in camera-type eye • Ангіогенез • definitive hemopoiesis • negative regulation of myeloid cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation • кровотворення
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 66.43 – 66.57 Mb
Хр. 11: 18.83 – 18.97 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MEIS1 (англ. Meis homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот , а молекулярна маса — 43 016[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAQRYDDLPH YGGMDGVGIP STMYGDPHAA RSMQPVHHLN HGPPLHSHQY
PHTAHTNAMA PSMGSSVNDA LKRDKDAIYG HPLFPLLALI FEKCELATCT
PREPGVAGGD VCSSESFNED IAVFAKQIRA EKPLFSSNPE LDNLMIQAIQ
VLRFHLLELE KVHELCDNFC HRYISCLKGK MPIDLVIDDR EGGSKSDSED
ITRSANLTDQ PSWNRDHDDT ASTRSGGTPG PSSGGHTSHS GDNSSEQGDG
LDNSVASPST GDDDDPDKDK KRHKKRGIFP KVATNIMRAW LFQHLTHPYP
SEEQKKQLAQ DTGLTILQVN NWFINARRRI VQPMIDQSNR AVSQGTPYNP
DGQPMGGFVM DGQQHMGIRA PGPMSGMGMN MGMEGQWHYM
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Smith J.E. Jr., Bollekens J.A., Inghirami G., Takeshita K. (1997). Cloning and mapping of the MEIS1 gene, the human homolog of a murine leukemogenic gene. Genomics . 43 : 99—103. PMID 9226379 DOI :10.1006/geno.1997.4766
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші