Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ELK3
Ідентифікатори
Символи
ELK3 , ERP, NET, SAP2, SAP-2, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK3
Зовнішні ІД
OMIM : 600247 MGI: 101762 HomoloGene: 3833 GeneCards: ELK3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • purine-rich negative regulatory element binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• мітохондрія • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• transcription, DNA-templated • диференціація клітин • Загоєння ран • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Ангіогенез • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 96.19 – 96.27 Mb
Хр. 10: 93.08 – 93.15 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ELK3 (англ. ELK3, ETS transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот , а молекулярна маса — 44 240[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MESAITLWQF LLQLLLDQKH EHLICWTSND GEFKLLKAEE VAKLWGLRKN
KTNMNYDKLS RALRYYYDKN IIKKVIGQKF VYKFVSFPEI LKMDPHAVEI
SRESLLLQDS DCKASPEGRE AHKHGLAALR STSRNEYIHS GLYSSFTINS
LQNPPDAFKA IKTEKLEEPP EDSPPVEEVR TVIRFVTNKT DKHVTRPVVS
LPSTSEAAAA SAFLASSVSA KISSLMLPNA ASISSASPFS SRSPSLSPNS
PLPSEHRSLF LEAACHDSDS LEPLNLSSGS KTKSPSLPPK AKKPKGLEIS
APPLVLSGTD IGSIALNSPA LPSGSLTPAF FTAQTPNGLL LTPSPLLSSI
HFWSSLSPVA PLSPARLQGP STLFQFPTLL NGHMPVPIPS LDRAASPVLL
SSNSQKS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Giovane A., Pintzas A., Maira S.-M., Sobieszczuk P., Wasylyk B. (1994). Net, a new ets transcription factor that is activated by Ras. Genes Dev . 8 : 1502—1513. PMID 7958835 DOI :10.1101/gad.8.13.1502
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Price M.A., Rogers A.E., Treisman R. (1995). Comparative analysis of the ternary complex factors Elk-1, SAP-1a and SAP-2 (ERP/NET). EMBO J . 14 : 2589—2601. PMID 7540136
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші