Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NR2F2
Ідентифікатори
Символи
NR2F2 , ARP1, CHTD4, COUPTFB, COUPTFII, NF-E3, NR2F1, SVP40, TFCOUP2, COUP-TFII, nuclear receptor subfamily 2 group F member 2, COUPTF2, ARP-1, SRXX5
Зовнішні ІД
OMIM : 107773 MGI: 1352452 HomoloGene: 7628 GeneCards: NR2F2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • retinoic acid binding • protein homodimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• trophoblast giant cell differentiation • response to estradiol • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • lipid metabolism • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • placenta blood vessel development • radial pattern formation • neuron migration • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • lymph vessel development • transcription, DNA-templated • negative regulation of endothelial cell migration • limb development • negative regulation of endothelial cell proliferation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • maternal placenta development • запліднення • forebrain development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • skeletal muscle tissue development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • anterior/posterior pattern specification • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • positive regulation of systemic arterial blood pressure
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 15: 96.33 – 96.34 Mb
Хр. 7: 70 – 70.02 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NR2F2 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот , а молекулярна маса — 45 571[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAMVVSTWRD PQDEVPGSQG SQASQAPPVP GPPPGAPHTP QTPGQGGPAS
TPAQTAAGGQ GGPGGPGSDK QQQQQHIECV VCGDKSSGKH YGQFTCEGCK
SFFKRSVRRN LSYTCRANRN CPIDQHHRNQ CQYCRLKKCL KVGMRREAVQ
RGRMPPTQPT HGQFALTNGD PLNCHSYLSG YISLLLRAEP YPTSRFGSQC
MQPNNIMGIE NICELAARML FSAVEWARNI PFFPDLQITD QVALLRLTWS
ELFVLNAAQC SMPLHVAPLL AAAGLHASPM SADRVVAFMD HIRIFQEQVE
KLKALHVDSA EYSCLKAIVL FTSDACGLSD VAHVESLQEK SQCALEEYVR
SQYPNQPTRF GKLLLRLPSL RTVSSSVIEQ LFFVRLVGKT PIETLIRDML
LSGSSFNWPY MAIQ
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Ladias J.A.A., Karathanasis S.K. (1991). Regulation of the apolipoprotein AI gene by ARP-1, a novel member of the steroid receptor superfamily . Science . 251 : 561—565. PMID 1899293 DOI :10.1126/science.1899293
Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett . 582 : 2737—2744. PMID 18619963 DOI :10.1016/j.febslet.2008.07.003
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Chu K., Zingg H.H. (1997). The nuclear orphan receptors COUP-TFII and Ear-2 act as silencers of the human oxytocin gene promoter. J. Mol. Endocrinol . 19 : 163—172. PMID 9343308 DOI :10.1677/jme.0.0190163
Wang L.H., Ing N.H., Tsai S.Y., O'Malley B.W., Tsai M.J. (1991). The COUP-TFs compose a family of functionally related transcription factors. Gene Expr . 1 : 207—216. PMID 1820218
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші