GTF2H2

GTF2H2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1Z60, 5IVW, 5IY9, 5IY8, 5IY7, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	GTF2H2, BTF2, BTF2P44, T-BTF2P44, TFIIH, p44, general transcription factor IIH subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601748 MGI: 1345669 HomoloGene: 1159 GeneCards: GTF2H2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase activity; • ATP-dependent activity, acting on DNA; • protein N-terminus binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • translation factor activity, RNA binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity; • nucleic acid binding; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • transcription factor TFIIH holo complex; • GO:0000441 transcription factor TFIIH core complex; • core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex; • клітинне ядро; • transcription factor TFIID complex; • nuclear speck;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • G protein-coupled receptor internalization; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • global genome nucleotide-excision repair; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • nucleotide-excision repair, DNA incision; • response to UV; • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly; • GO:0100026 Репарація ДНК; • Біосинтез білків; • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion; • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization; • protein phosphorylation; • nucleotide-excision repair; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of DNA helicase activity; • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding; • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion; • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2966
	23894
	ENSG00000145736; ENSG00000276910; ENSG00000275045
	ENSMUSG00000021639
	Q13888
	Q9JIB4
	NM_001515
	NM_022011; NM_001360706
NP_001506; NP_001351496; NP_001351497; NP_001351498; NP_001351499;
	NP_001351500; NP_001351501; NP_001351502
	NP_071294; NP_001347635
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GTF2H2 (англ. General transcription factor IIH subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 44 419^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEEPERTKR	WEGGYERTWE	ILKEDESGSL	KATIEDILFK	AKRKRVFEHH
GQVRLGMMRH	LYVVVDGSRT	MEDQDLKPNR	LTCTLKLLEY	FVEEYFDQNP
ISQIGIIVTK	SKRAEKLTEL	SGNPRKHITS	LKKAVDMTCH	GEPSLYNSLS
IAMQTLKHMP	GHTSREVLII	FSSLTTCDPS	NIYDLIKTLK	AAKIRVSVIG
LSAEVRVCTV	LARETGGTYH	VILDESHYKE	LLTHHVSPPP	ASSSSECSLI
RMGFPQHTIA	SLSDQDAKPS	FSMAHLDGNT	EPGLTLGGYF	CPQCRAKYCE
LPVECKICGL	TLVSAPHLAR	SYHHLFPLDA	FQEIPLEEYN	GERFCYGCQG
ELKDQHVYVC	AVCQNVFCVD	CDVFVHDSLH	CCPGCIHKIP	APSGV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Tremeau-Bravard A., Perez C., Egly J.-M. (2001). A role of the C-terminal part of p44 in the promoter escape activity of transcription factor IIH. J. Biol. Chem. 276: 27693—27697. PMID 11319235 DOI:10.1074/jbc.M102457200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4656 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 31 серпня 2017. [Архівовано 2016-04-03 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q13888 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4656 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 31 серпня 2017. [Архівовано 2016-04-03 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q13888 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]