Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DBX1
Ідентифікатори
Символи
DBX1 , developing brain homeobox 1, HLX1
Зовнішні ІД
MGI: 94867 HomoloGene: 19002 GeneCards: DBX1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • ventral spinal cord interneuron specification • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell differentiation in spinal cord
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 11: 20.16 – 20.16 Mb
Хр. 7: 49.28 – 49.29 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
DBX1 (англ. Developing brain homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот , а молекулярна маса — 37 283[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMFPGLLAPP AGYPSLLRPT PTLTLPQSLQ SAFSGHSSFL VEDLIRISRP
PAYLPRSVPT ASMSPPRQGA PTALTDTGAS DLGSPGPGSR RGGSPPTAFS
PASETTFLKF GVNAILSSGP RTETSPALLQ SVPPKTFAFP YFEGSFQPFI
RSSYFPASSS VVPIPGTFSW PLAARGKPRR GMLRRAVFSD VQRKALEKMF
QKQKYISKPD RKKLAAKLGL KDSQVKIWFQ NRRMKWRNSK ERELLSSGGC
REQTLPTKLN PHPDLSDVGQ KGPGNEEEEE GPGSPSHRLA YHASSDPQHL
RDPRLPGPLP PSPAHSSSPG KPSDFSDSEE EEEGEEQEEI TVS
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші