RUNX1T1

RUNX1T1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WQ6, 2DJ8, 2H7B, 2KYG, 2OD1, 2ODD, 2PP4, 4JOL
Ідентифікатори
Символи	RUNX1T1, AML1T1, CBFA2T1, CDR, ETO, MTG8, ZMYND2, AML1-MTG8, t(8;21)(q22;q22), RUNX1 translocation partner 1, RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 133435 MGI: 104793 HomoloGene: 3801 GeneCards: RUNX1T1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • nuclear matrix • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • negative regulation of fat cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • generation of precursor metabolites and energy • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	862	12395
Ensembl	ENSG00000079102	ENSMUSG00000006586
UniProt	Q06455	Q61909
RefSeq (мРНК)	NM_001198625 NM_001198626 NM_001198627 NM_001198628 NM_001198629 NM_001198630 NM_001198631 NM_001198632 NM_001198633 NM_001198634 NM_001198679 NM_004349 NM_175634 NM_175635 NM_175636 NM_001395209	NM_001111026 NM_001111027 NM_009822
RefSeq (білок)	NP_001185554 NP_001185555 NP_001185556 NP_001185557 NP_001185558 NP_001185559 NP_001185560 NP_001185561 NP_001185562 NP_001185563 NP_001185608 NP_004340 NP_783552 NP_783553 NP_783554 NP_783553.1 NP_783554.1	NP_001104496 NP_001104497 NP_033952
Локус (UCSC)	Хр. 8: 91.95 – 92.1 Mb	Хр. 4: 13.74 – 13.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RUNX1T1 (англ. RUNX1 translocation partner 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 604 амінокислот, а молекулярна маса — 67 566.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MISVKRNTWR		ALSLVIGDCR		KKGNFEYCQD		RTEKHSTMPD		SPVDVKTQSR
LTPPTMPPPP		TTQGAPRTSS		FTPTTLTNGT		SHSPTALNGA		PSPPNGFSNG
PSSSSSSSLA		NQQLPPACGA		RQLSKLKRFL		TTLQQFGNDI		SPEIGERVRT
LVLGLVNSTL		TIEEFHSKLQ		EATNFPLRPF		VIPFLKANLP		LLQRELLHCA
RLAKQNPAQY		LAQHEQLLLD		ASTTSPVDSS		ELLLDVNENG		KRRTPDRTKE
NGFDREPLHS		EHPSKRPCTI		SPGQRYSPNN		GLSYQPNGLP		HPTPPPPQHY
RLDDMAIAHH		YRDSYRHPSH		RDLRDRNRPM		GLHGTRQEEM		IDHRLTDREW
AEEWKHLDHL		LNCIMDMVEK		TRRSLTVLRR		CQEADREELN		YWIRRYSDAE
DLKKGGGSSS		SHSRQQSPVN		PDPVALDAHR		EFLHRPASGY		VPEEIWKKAE
EAVNEVKRQA		MTELQKAVSE		AERKAHDMIT		TERAKMERTV		AEAKRQAAED
ALAVINQQED		SSESCWNCGR		KASETCSGCN		TARYCGSFCQ		HKDWEKHHHI
CGQTLQAQQQ		GDTPAVSSSV		TPNSGAGSPM		DTPPAATPRS		TTPGTPSTIE
TTPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Wolford J.K., Prochazka M. (1998). Structure and expression of the human MTG8/ETO gene. Gene. 212: 103—109. PMID 9661669 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00141-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Davis J.N., McGhee L., Meyers S. (2003). The ETO (MTG8) gene family. Gene. 303: 1—10. PMID 12559562 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01172-1
• Rossetti S., Hoogeveen A.T., Sacchi N. (2004). The MTG proteins: chromatin repression players with a passion for networking. Genomics. 84: 1—9. PMID 15203199 DOI:10.1016/j.ygeno.2004.02.011
• Kwok C., Zeisig B.B., Qiu J., Dong S., So C.W. (2009). Transforming activity of AML1-ETO is independent of CBFbeta and ETO interaction but requires formation of homo-oligomeric complexes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 2853—2858. PMID 19202074 DOI:10.1073/pnas.0810558106
• Plevin M.J., Zhang J., Guo C., Roeder R.G., Ikura M. (2006). The acute myeloid leukemia fusion protein AML1-ETO targets E proteins via a paired amphipathic helix-like TBP-associated factor homology domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 10242—10247. PMID 16803958 DOI:10.1073/pnas.0603463103

Див. також

• Хромосома 8