Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MAFB
Ідентифікатори
Символи
MAFB , KRML, MCTO, MAF bZIP transcription factor B, DURS3
Зовнішні ІД
OMIM : 608968 MGI: 104555 HomoloGene: 31315 GeneCards: MAFB
Пов'язані генетичні захворювання
multicentric carpo-tarsal osteolysis with or without nephropathy [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • sequence-specific double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• T cell differentiation in thymus • negative regulation of osteoclast differentiation • brain segmentation • thymus development • transcription by RNA polymerase II • respiratory gaseous exchange by respiratory system • segment specification • negative regulation of erythrocyte differentiation • нейробіологія розвитку • transcription, DNA-templated • rhombomere 6 development • rhombomere 5 development • inner ear morphogenesis • sensory organ development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • abducens nerve formation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 20: 40.69 – 40.69 Mb
Хр. 2: 160.21 – 160.21 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MAFB (англ. MAF bZIP transcription factor B ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 323 амінокислот , а молекулярна маса — 35 792[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAELSMGPE LPTSPLAMEY VNDFDLLKFD VKKEPLGRAE RPGRPCTRLQ
PAGSVSSTPL STPCSSVPSS PSFSPTEQKT HLEDLYWMAS NYQQMNPEAL
NLTPEDAVEA LIGSHPVPQP LQSFDSFRGA HHHHHHHHPH PHHAYPGAGV
AHDELGPHAH PHHHHHHQAS PPPSSAASPA QQLPTSHPGP GPHATASATA
AGGNGSVEDR FSDDQLVSMS VRELNRHLRG FTKDEVIRLK QKRRTLKNRG
YAQSCRYKRV QQKHHLENEK TQLIQQVEQL KQEVSRLARE RDAYKVKCEK
LANSGFREAG STSDSPSSPE FFL
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші