HOXD3

HOXD3
Ідентифікатори
Символи	HOXD3, HOX1D, HOX4, HOX4A, Hox-4.1, homeobox D3
Зовнішні ІД	OMIM: 142980 MGI: 96207 HomoloGene: 5034 GeneCards: HOXD3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• aggresome; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch; • glossopharyngeal nerve morphogenesis; • embryonic skeletal system morphogenesis; • multicellular organism development; • thyroid gland development; • cartilage development; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • cell-matrix adhesion; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of neuron differentiation; • transcription, DNA-templated; • anterior/posterior pattern specification; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3232
	15434
	ENSG00000128652
	ENSMUSG00000079277
	P31249
	P09027
	NM_006898
	NM_010468
	NP_008829
	NP_034598
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXD3 (англ. Homeobox D3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 432 амінокислот, а молекулярна маса — 45 730^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLFEQGQQAL	ELPECTMQKA	AYYENPGLFG	GYGYSKTTDT	YGYSTPHQPY
PPPAAASSLD	TDYPGSACSI	QSSAPLRAPA	HKGAELNGSC	MRPGTGNSQG
GGGGSQPPGL	NSEQQPPQPP	PPPPTLPPSS	PTNPGGGVPA	KKPKGGPNAS
SSSATISKQI	FPWMKESRQN	SKQKNSCATA	GESCEDKSPP	GPASKRVRTA
YTSAQLVELE	KEFHFNRYLC	RPRRVEMANL	LNLTERQIKI	WFQNRRMKYK
KDQKAKGILH	SPASQSPERS	PPLGGAAGHV	AYSGQLPPVP	GLAYDAPSPP
AFAKSQPNMY	GLAAYTAPLS	SCLPQQKRYA	APEFEPHPMA	SNGGGFASAN
LQGSPVYVGG	NFVESMAPAS	GPVFNLGHLS	HPSSASVDYS	CAAQIPGNHH
HGPCDPHPTY	TDLSAHHSSQ	GRLPEAPKLT	HL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Taniguchi Y., Fujii A., Moriuchi T. (1992). Cloning and sequencing of the human homeobox gene HOX4A. Biochim. Biophys. Acta. 1132: 332—334. PMID 1358204 doi:10.1016/0167-4781(92)90173-W
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5137 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P31249 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.