Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RUNX3
Ідентифікатори
Символи
RUNX3 , AML2, CBFA3, PEBP2aC, runt related transcription factor 3, RUNX family transcription factor 3
Зовнішні ІД
OMIM : 600210 MGI: 102672 HomoloGene: 37914 GeneCards: RUNX3
Пов'язані генетичні захворювання
Хвороба Крона [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • гіалоплазма • core-binding factor complex
Біологічний процес
• peripheral nervous system neuron development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chondrocyte differentiation • осифікація • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • negative regulation of epithelial cell proliferation • регуляція диференціювання клітин • response to transforming growth factor beta • кровотворення • negative regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation • neuron differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 24.9 – 24.97 Mb
Хр. 4: 134.85 – 134.91 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
RUNX3 (англ. Runt related transcription factor 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 415 амінокислот , а молекулярна маса — 44 356[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MRIPVDPSTS RRFTPPSPAF PCGGGGGKMG ENSGALSAQA AVGPGGRARP
EVRSMVDVLA DHAGELVRTD SPNFLCSVLP SHWRCNKTLP VAFKVVALGD
VPDGTVVTVM AGNDENYSAE LRNASAVMKN QVARFNDLRF VGRSGRGKSF
TLTITVFTNP TQVATYHRAI KVTVDGPREP RRHRQKLEDQ TKPFPDRFGD
LERLRMRVTP STPSPRGSLS TTSHFSSQPQ TPIQGTSELN PFSDPRQFDR
SFPTLPTLTE SRFPDPRMHY PGAMSAAFPY SATPSGTSIS SLSVAGMPAT
SRFHHTYLPP PYPGAPQNQS GPFQANPSPY HLYYGTSSGS YQFSMVAGSS
SGGDRSPTRM LASCTSSAAS VAAGNLMNPS LGGQSDGVEA DGSHSNSPTA
LSTPGRMDEA VWRPY
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші