GTF2H4

GTF2H4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IY9, 5IVW, 5IY7, 5IY8, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	GTF2H4, general transcription factor IIH, polypeptide 4, 52kDa, P52, TFB2, TFIIH, general transcription factor IIH subunit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 601760 MGI: 1338799 HomoloGene: 7090 GeneCards: GTF2H4
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase activity • ATP-dependent activity, acting on DNA • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0004003 DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • double-stranded DNA binding • ATPase activator activity • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • transcription factor TFIIH holo complex • core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex • GO:0000441 transcription factor TFIIH core complex • клітинне ядро • transcription factor TFIID complex • nuclear speck Біологічний процес • termination of RNA polymerase I transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • global genome nucleotide-excision repair • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • nucleotide-excision repair, DNA incision • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • DNA duplex unwinding • positive regulation of ATP-dependent activity • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2968	14885
Ensembl	ENSG00000213780	ENSMUSG00000001524
UniProt	Q92759	O70422
RefSeq (мРНК)	NM_001517	NM_010364
RefSeq (білок)	NP_001508	NP_034494
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.91 – 30.91 Mb	Хр. 17: 35.98 – 35.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GTF2H4 (англ. General transcription factor IIH subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 52 186.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESTPSRGLN		RVHLQCRNLQ		EFLGGLSPGV		LDRLYGHPAT		CLAVFRELPS
LAKNWVMRML		FLEQPLPQAA		VALWVKKEFS		KAQEESTGLL		SGLRIWHTQL
LPGGLQGLIL		NPIFRQNLRI		ALLGGGKAWS		DDTSQLGPDK		HARDVPSLDK
YAEERWEVVL		HFMVGSPSAA		VSQDLAQLLS		QAGLMKSTEP		GEPPCITSAG
FQFLLLDTPA		QLWYFMLQYL		QTAQSRGMDL		VEILSFLFQL		SFSTLGKDYS
VEGMSDSLLN		FLQHLREFGL		VFQRKRKSRR		YYPTRLAINL		SSGVSGAGGT
VHQPGFIVVE		TNYRLYAYTE		SELQIALIAL		FSEMLYRFPN		MVVAQVTRES
VQQAIASGIT		AQQIIHFLRT		RAHPVMLKQT		PVLPPTITDQ		IRLWELERDR
LRFTEGVLYN		QFLSQVDFEL		LLAHARELGV		LVFENSAKRL		MVVTPAGHSD
VKRFWKRQKH		SS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444

Див. також

• Хромосома 6