RFXANK

RFXANK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3UXG, 3V30, 4QQM
Ідентифікатори
Символи	RFXANK, ANKRA1, BLS, F14150_1, RFX-B, regulatory factor X associated ankyrin containing protein
Зовнішні ІД	OMIM: 603200 MGI: 1333865 HomoloGene: 2760 GeneCards: RFXANK
Пов'язані генетичні захворювання
bare lymphocyte syndrome 2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • histone deacetylase binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • intercellular bridge • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Ras protein signal transduction • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8625	19727
Ensembl	ENSG00000064490	ENSMUSG00000036120
UniProt	O14593	Q9Z205
RefSeq (мРНК)	NM_001278727 NM_001278728 NM_003721 NM_134440 NM_001370233 NM_001370234 NM_001370235 NM_001370236 NM_001370237 NM_001370238	NM_001025589 NM_011266
RefSeq (білок)	NP_001265656 NP_001265657 NP_003712 NP_604389 NP_001357162 NP_001357163 NP_001357164 NP_001357165 NP_001357166 NP_001357167	NP_001020760 NP_035396
Локус (UCSC)	Хр. 19: 19.19 – 19.2 Mb	Хр. 8: 70.58 – 70.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFXANK (англ. Regulatory factor X associated ankyrin containing protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 28 102.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELTQPAEDL		IQTQQTPASE		LGDPEDPGEE		AADGSDTVVL		SLFPCTPEPV
NPEPDASVSS		PQAGSSLKHS		TTLTNRQRGN		EVSALPATLD		SLSIHQLAAQ
GELDQLKEHL		RKGDNLVNKP		DERGFTPLIW		ASAFGEIETV		RFLLEWGADP
HILAKERESA		LSLASTGGYT		DIVGLLLERD		VDINIYDWNG		GTPLLYAVRG
NHVKCVEALL		ARGADLTTEA		DSGYTPMDLA		VALGYRKVQQ		VIENHILKLF
QSNLVPADPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Laird K.M., Briggs L.L., Boss J.M., Summers M.F., Garvie C.W. (2010). Solution structure of the heterotrimeric complex between the interaction domains of RFX5 and RFXAP from the RFX gene regulatory complex. J. Mol. Biol. 403: 40—51. PMID 20732328 DOI:10.1016/j.jmb.2010.08.025
• Nagarajan U.M., Peijnenburg A., Gobin S.J., Boss J.M., van den Elsen P.J. (2000). Novel mutations within the RFX-B gene and partial rescue of MHC and related genes through exogenous class II transactivator in RFX-B-deficient cells. J. Immunol. 164: 3666—3674. PMID 10725724 DOI:10.4049/jimmunol.164.7.3666

Див. також

• Хромосома 19