欠陥とは? わかりやすく解説

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けっ‐かん【欠陥】

読み方:けっかん

欠けて足りないこと。不備な点。「論理上の—を衝(つ)く」「—商品

「欠陥」に似た言葉

欠陥

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2019/06/08 14:47 UTC 版)

欠陥(けっかん)とは、理想状態を想定できる物事における理想状態との違いである。




「欠陥」の続きの解説一覧

欠陥

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/01/26 10:04 UTC 版)

力場 (化学)」の記事における「欠陥」の解説

全ての力場数値的近似基づいており、種々の実験データから得られる。したがって、これらは「経験的」であると言われる一部力場は、原子部分電荷静電的相互作用顕著に減少させる環境電子的分極考慮してない。この問題は「分極力場」を開発することによって、あるいは巨視的誘電率用いることによって解決することができる。しかしながら単一誘電率の値の適用は、タンパク質生体膜の高度に不均一環境では疑問余地があり、誘電体性質用いられるモデル依存するファンデルワールス力全ての種類も、これらの力が誘起双極子と「瞬間的双極子相互作用由来しているため、環境強く依存している。これらの力に関する最初フリッツ・ロンドン理論真空中においてのみ適用可能である。凝集媒質中でのファンデルワールス力のより一般的な理論1963年A. D. McLachlanによって開発された(この理論は元のロンドンアプローチ特殊な場合として含む)。McLachlan理論媒質中でのファンデルワールス力真空中よりも弱く異な種類原子は同じ種類原子よりも弱く相互作用すことを意味するlike dissolves like」則に従うことを予測する。これは古典力場開発応用され連結則(スレイターカークウッド方程式)と対照的である。「連結則」は、2つ異な原子例えばC…N)の相互作用エネルギーは、対応する同一原子の対(すなわちC…CおよびN…N)の相互作用エネルギー平均である、と述べる。McLachlan理論によれば媒質中での粒子相互作用は、液体ヘリウムについて観察されるように、完全に反発的にもなりうる。McLachlan理論結論は、異な材料間の引力(ハーマーカー定数)の直接的測定によって支持されるJacob Israelachviliの著書「Intermolecular and surface forces」では、「水中での炭化水素間の相互作用真空中での相互作用の約10%である」と結論付けられている。こういった効果標準的な分子力学では考慮されていないもう一つ批判は、タンパク質構造精緻化といった実際的応用から来ている。CASPCritical Assessment of protein Structure Prediction)の参加者らが「分子力学主要な問題、すなわちエネルギー最小化あるいは分子動力学一般的に実験構造とは似ていないモデルを導くこと」を避けるために彼らのモデル精緻化試みなかったことは知られていた。力場種々のX線結晶構造解析およびNMR分光法において、特にXPLORプログラム用いたタンパク質構造精緻化にうまく適用されてきた。しかしながらこのような精緻化一連の実験的制約によって主に決定され力場は単に原子障害取り除くために使われるに過ぎない計算結果はDYANAプログラム実装されている剛球ポテンシャルNMRデータからの計算)あるいはエネルギー関数用いない結晶構造精緻化のためのプログラムよるもの実質的に同じである。力場の欠陥はタンパク質ホモロジーモデリングにおける主要な障害であり続けている。このような状況から、リガンドドッキングやタンパク質折り畳み、ホモロジーモデルの精緻化計算によるタンパク質設計、膜中のタンパク質モデリング専用経験的スコアリング関数開発されることとなった分子力学法タンパク質折り畳みあるいはリガンド結合に対して的外れなエネルギー用いて動いているという意見存在する典型的な力場パラメータ昇華エンタルピー、すなわち分子結晶蒸発エネルギー再現するしかしながらタンパク質折り畳みおよびリガンド結合結晶化あるいは液体-固体転移熱力学的に非常に似ていることが認識されていた。これは、これらの全ての過程凝集媒質中での運動性の分子の「凍結」を表わすためである。したがってタンパク質折り畳みあるいはリガンド結合の間の自由エネルギー変化融解熱分子結晶融解の間に吸収されるエネルギー)、配座エントロピー寄与溶媒和自由エネルギー似たエネルギー組み合わせ相当するはずである。融解熱昇華エンタルピーよりも著しく小さい。ゆえに、タンパク質折り畳みあるいはリガンド結合記述するポテンシャル分子力学法におけるポテンシャルよりも弱くなければならない実際にタンパク質中の水素結合エネルギーは、タンパク質工学あるいはαヘリックスからコイルへの遷移データから見積った時は ~ -1.5 kcal/molであるが、分子結晶昇華エンタルピーから見積った同じエネルギーは-4 ~ -6 kcal/molであったまた、タンパク質工学データ由来する改良レナード=ジョーンズ・ポテンシャル深さ典型的な力場のものよりも小さくMcLachlan理論によって予測されるように「like dissolves like似たもの同士はよく溶ける)」則に従った

※この「欠陥」の解説は、「力場 (化学)」の解説の一部です。
「欠陥」を含む「力場 (化学)」の記事については、「力場 (化学)」の概要を参照ください。

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欠陥

出典:『Wiktionary』 (2021/10/05 15:07 UTC 版)

発音

名詞

(けっかん)

  1. 本来持たねばならない要素欠いていること。

関連語

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「欠陥」の例文・使い方・用例・文例

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