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前回の記事
これまで地上に現れたすべての思想ideasのつながりを１枚にまとめたインフォグラフィック 読書猿Classic: between / beyond readers
の、少しだけ補遺。
哲学者、文学者、芸術家やその他もろもろ、数千の思想家の間の影響関係をひとつのチャートにマッシュアップしたGraph of Ideas。
実は、これをつくったBrendan Griffenは、影響を与えた者と影響を受けた者をコンマで区切っただけのcsvファイルだけれど、元になったデータを公開してくれている。
All Influences Wikipedia.csv
さらにGriffenがつかったネットワーク可視化・分析ソフトGephiは、ほとんどマウス操作だけで、巨大／美麗なネットワークグラフが描けて、おまけにオープンソースソフトウェアで、日本語サイトやチュートリアルまである。
何かのフラグが立ったような気がしたので、Gephiをダウンロードして、件のcsvファイルを流し込んでみた。
（・CSV データのインポート）
この記事は、ネットワーク可視化・分析ソフトの紹介ではなく、はじめてソフトに触った素人による、その敷居の意外な低さ（チュートリアルをみただけでできること）についての証言である。
１ ファイルを取り込むとグラフが描かれる
次のが、ただファイルメニューから「開く...」でcsvファイルを開いたところ。
ノード数3594（これが思想家の数）、辺（エッジ）数5011（これが影響関係の数）のネットワークがとりあえず描けた。
（クリックで拡大）
２ メジャーな思想家を選び出す
これだけだと配置はバラバラだし、ぎっしり詰め込んだだけなので、各ノードのラベル（思想家の名前）を表示しようものなら、とても読めない。
各ノードをばらけさせようかと思ったが、所詮は絵に過ぎなかったZoom.Itとは違い、せっかくネットワーク・データを取り扱えるソフトに取り込んだのだから、いろいろいじってみることにする。
まず他の多くの思想家と影響関係を取り結んでいるメジャー思想家だけをピックアップしてみよう。
フィルタ機能をつかって、「トポロジ」の中の「出次数範囲」をドラッグしてクエリーにぶち込む。
すると「出次数範囲 設定」というスライドバーが出るからこれを調整する。
たとえば「出次数範囲２０以上」を選んでフィルタボタンを押すと、２０人以上の思想家に影響を与えている思想家だけが選び出される。
するとノード数で２４まで絞り込まれ、影響数の特に多い思想家２４人が選び出される。
思想家名を表示すると、文字の重なりがあって読みにくいから、「レイアウト機能」の「ラベルの調整」をつかって重ならないようにしよう。
（クリックで拡大）
そこそこのメンバーが選出された。
ジョージ・カーリンとレニー・ブルース、それとスティーブ・マーティンとコメディアンたちが孤立しているが、気にせず次へ行こう。
３ 特定の思想家とつながりある者だけを表示する
「ロールズがいない」とつぶやいていた人がいたので、John Rawlsと彼と影響関係がある思想家を「フィルター機能」の「エゴ・ネットワーク」で選び出そう。
まずは画面上部の「データ工房」を押し、フィルタに「Rawls」と入力して、ノードに彼がいることを確認する。再び「概観」タブに戻り、「トポロジ」の中の「エゴ・ネットワーク」をドラッグしてクエリーにぶち込む。ノードのIDにはさっき確認した「John Rawls」を入力、深さを「１」にして、フィルタボタンを押す。すると、７つのノードが選ばれた。
（クリックで拡大）
これを深さを「２」にして、影響のある者とさらに影響がある者まで選ぶと、ノード数は一気に９５まで増える。
そのままだと肝心のロールズが埋もれてしまうので着色＋大きさを拡大し、ロールズと直接関係がある者も着色した。
４ すべての思想家を配置したマップを描く
では、最後に各ノードを適当にバラけさせて、我々の思想家マップをつくってみよう。
（１）まず結びつきの情報を使って、ノードを分類して色分けする。
「統計」機能から「モジュラリティ」（コミュニティ検出）を実行する。そえから「パーティション」機能から、ノードタブを選んで、矢印が循環したマークの更新ボタンを押す。するとポップアップメニューがアクティブになってパーティションパラメータを選択できる。今、計算したModularity Classが選択でいるからこれを選んで、適用ボタンを押すと、ノードの色分けがなされる。
（クリックで拡大）
（２）レイアウト機能を使って、ノードをばらけさせて配置する。「レイアウトを選択」のポップアップメニューからForceAtlas２を選び、クラスタリングがより強くかかるLinLogモードにチェックを入れて実行ボタンを押すと、ノードが互いに遠ざかっていく。配置が落ち着いたら中止ボタンを押して止める。
（３）ノードごとに軽重をつけよう。ランキング機能からノードタブを選び、ランクパラメータを選択というポップアップメニューから「次数」を選択。右から３番目の下向き▽のアイコンをクリックして、ノードの大きさを決める。最小サイズ１０、最大サイズ２００にして、適用ボタンを押す。
（４）グラフウインドウの右下にある「T」を押すとラベル（ここでは思想家の名前）が表示される。中央の右側の「A」（サイズモード）からNode Sizeを選ぶと、大きなノードのラベルは大きく、小さいノードのラベルは小さく表示される。その右隣のスライドバーで、全体の文字の大きさが調節できる。
（５）最後に画面上部の「プレビュー」を押すと、出力用のグラフが得られる。画面右下のエクスポートボタンで、SVG／PDF／PNGへ出力できる。
＊（おまけ）上のグラフのsvgファイル とpdfファイル
本当はもう少し手を加えて見やすくすべきだが、少ない手間でここまで描くことができる。
※ほんとはGephiでつくった（絵ではなく）インタラクティブなネットワーク図（ウェブ上で拡大したりドラッグできる）を公開できるのだが（たとえば、gexf-jsとかsigma.jsを使えば）ちょっとそこまでやれなかった。
・gexf-jsの例 ユーゴー「レ・ミゼラブル」の登場人物の相関関係
・sigma.jsの例 Hanzi Network / 汉字网
（補遺の補遺）
ここまで来れば、データさえあれば、思想家マップの日本語版だって簡単にできそうに思える。
そう、データさえあれば。
そういえばGriffen氏は、DBpedia（http://dbpedia.org/sparql）経由でWikipediaのデータを手に入れた、と書いていた（実はGephiには、DBpediaにも対応した、データを直接引っ張って来れるSemantic WebI mportというプラグインがある。データを得る具体的な方法は、次の記事How to Use Gephi to Visualize Related Entries in Wikipedia が参考になる。）。
本家のDBpediaは主にWikipedia英語版を対象としているが、DBpediaならば日本語版（http://ja.dbpedia.org/）だってある。 これはWikipedia日本語版を対象としていたはずだ。
すでに時間切れだが、http://ja.dbpedia.org/sparqlから、いろんな意味で最低限のQueryでもって、ウィキペディア日本語の「影響を与えた人物」の項があるものを引っ張ってきて、Gephiに流し込んでみたのが最後にあげたグラフ。
（クリックで拡大）
これまで地上に現れたすべての思想ideasのつながりを１枚にまとめたインフォグラフィック 読書猿Classic: between / beyond readers
の、少しだけ補遺。
哲学者、文学者、芸術家やその他もろもろ、数千の思想家の間の影響関係をひとつのチャートにマッシュアップしたGraph of Ideas。
実は、これをつくったBrendan Griffenは、影響を与えた者と影響を受けた者をコンマで区切っただけのcsvファイルだけれど、元になったデータを公開してくれている。
All Influences Wikipedia.csv
さらにGriffenがつかったネットワーク可視化・分析ソフトGephiは、ほとんどマウス操作だけで、巨大／美麗なネットワークグラフが描けて、おまけにオープンソースソフトウェアで、日本語サイトやチュートリアルまである。
Gephi ・本家サイト https://gephi.org/ ・日本語サイト http://oss.infoscience.co.jp/gephi/gephi.org/ （・ユーザーインタフェースの説明 ・サポートされているグラフ形式） ・日本語チュートリアル クイックスタート ←まずはこれだけ （・日本語チュートリアル 可視化） Gephiをダウンロード 最新の安定版 Gephi 0.8 Alpha 最新のベータ版（こちらはメニュー等日本語化されてる。後述のSemantic Web Import pluginを使うにはこちらが必要） Version 0.8.1-beta https://gephi.org/users/download/ |
何かのフラグが立ったような気がしたので、Gephiをダウンロードして、件のcsvファイルを流し込んでみた。
（・CSV データのインポート）
この記事は、ネットワーク可視化・分析ソフトの紹介ではなく、はじめてソフトに触った素人による、その敷居の意外な低さ（チュートリアルをみただけでできること）についての証言である。
１ ファイルを取り込むとグラフが描かれる
次のが、ただファイルメニューから「開く...」でcsvファイルを開いたところ。
ノード数3594（これが思想家の数）、辺（エッジ）数5011（これが影響関係の数）のネットワークがとりあえず描けた。
（クリックで拡大）
２ メジャーな思想家を選び出す
これだけだと配置はバラバラだし、ぎっしり詰め込んだだけなので、各ノードのラベル（思想家の名前）を表示しようものなら、とても読めない。
各ノードをばらけさせようかと思ったが、所詮は絵に過ぎなかったZoom.Itとは違い、せっかくネットワーク・データを取り扱えるソフトに取り込んだのだから、いろいろいじってみることにする。
まず他の多くの思想家と影響関係を取り結んでいるメジャー思想家だけをピックアップしてみよう。
フィルタ機能をつかって、「トポロジ」の中の「出次数範囲」をドラッグしてクエリーにぶち込む。
すると「出次数範囲 設定」というスライドバーが出るからこれを調整する。
たとえば「出次数範囲２０以上」を選んでフィルタボタンを押すと、２０人以上の思想家に影響を与えている思想家だけが選び出される。
するとノード数で２４まで絞り込まれ、影響数の特に多い思想家２４人が選び出される。
思想家名を表示すると、文字の重なりがあって読みにくいから、「レイアウト機能」の「ラベルの調整」をつかって重ならないようにしよう。
（クリックで拡大）
そこそこのメンバーが選出された。
ジョージ・カーリンとレニー・ブルース、それとスティーブ・マーティンとコメディアンたちが孤立しているが、気にせず次へ行こう。
３ 特定の思想家とつながりある者だけを表示する
「ロールズがいない」とつぶやいていた人がいたので、John Rawlsと彼と影響関係がある思想家を「フィルター機能」の「エゴ・ネットワーク」で選び出そう。
まずは画面上部の「データ工房」を押し、フィルタに「Rawls」と入力して、ノードに彼がいることを確認する。再び「概観」タブに戻り、「トポロジ」の中の「エゴ・ネットワーク」をドラッグしてクエリーにぶち込む。ノードのIDにはさっき確認した「John Rawls」を入力、深さを「１」にして、フィルタボタンを押す。すると、７つのノードが選ばれた。
（クリックで拡大）
これを深さを「２」にして、影響のある者とさらに影響がある者まで選ぶと、ノード数は一気に９５まで増える。
そのままだと肝心のロールズが埋もれてしまうので着色＋大きさを拡大し、ロールズと直接関係がある者も着色した。
４ すべての思想家を配置したマップを描く
では、最後に各ノードを適当にバラけさせて、我々の思想家マップをつくってみよう。
（１）まず結びつきの情報を使って、ノードを分類して色分けする。
「統計」機能から「モジュラリティ」（コミュニティ検出）を実行する。そえから「パーティション」機能から、ノードタブを選んで、矢印が循環したマークの更新ボタンを押す。するとポップアップメニューがアクティブになってパーティションパラメータを選択できる。今、計算したModularity Classが選択でいるからこれを選んで、適用ボタンを押すと、ノードの色分けがなされる。
（クリックで拡大）
（２）レイアウト機能を使って、ノードをばらけさせて配置する。「レイアウトを選択」のポップアップメニューからForceAtlas２を選び、クラスタリングがより強くかかるLinLogモードにチェックを入れて実行ボタンを押すと、ノードが互いに遠ざかっていく。配置が落ち着いたら中止ボタンを押して止める。
（３）ノードごとに軽重をつけよう。ランキング機能からノードタブを選び、ランクパラメータを選択というポップアップメニューから「次数」を選択。右から３番目の下向き▽のアイコンをクリックして、ノードの大きさを決める。最小サイズ１０、最大サイズ２００にして、適用ボタンを押す。
（４）グラフウインドウの右下にある「T」を押すとラベル（ここでは思想家の名前）が表示される。中央の右側の「A」（サイズモード）からNode Sizeを選ぶと、大きなノードのラベルは大きく、小さいノードのラベルは小さく表示される。その右隣のスライドバーで、全体の文字の大きさが調節できる。
（５）最後に画面上部の「プレビュー」を押すと、出力用のグラフが得られる。画面右下のエクスポートボタンで、SVG／PDF／PNGへ出力できる。
＊（おまけ）上のグラフのsvgファイル とpdfファイル
本当はもう少し手を加えて見やすくすべきだが、少ない手間でここまで描くことができる。
※ほんとはGephiでつくった（絵ではなく）インタラクティブなネットワーク図（ウェブ上で拡大したりドラッグできる）を公開できるのだが（たとえば、gexf-jsとかsigma.jsを使えば）ちょっとそこまでやれなかった。
・gexf-jsの例 ユーゴー「レ・ミゼラブル」の登場人物の相関関係
・sigma.jsの例 Hanzi Network / 汉字网
（補遺の補遺）
ここまで来れば、データさえあれば、思想家マップの日本語版だって簡単にできそうに思える。
そう、データさえあれば。
そういえばGriffen氏は、DBpedia（http://dbpedia.org/sparql）経由でWikipediaのデータを手に入れた、と書いていた（実はGephiには、DBpediaにも対応した、データを直接引っ張って来れるSemantic WebI mportというプラグインがある。データを得る具体的な方法は、次の記事How to Use Gephi to Visualize Related Entries in Wikipedia が参考になる。）。
本家のDBpediaは主にWikipedia英語版を対象としているが、DBpediaならば日本語版（http://ja.dbpedia.org/）だってある。 これはWikipedia日本語版を対象としていたはずだ。
すでに時間切れだが、http://ja.dbpedia.org/sparqlから、いろんな意味で最低限のQueryでもって、ウィキペディア日本語の「影響を与えた人物」の項があるものを引っ張ってきて、Gephiに流し込んでみたのが最後にあげたグラフ。
（クリックで拡大）
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