Oligo/BAC CGH Array 解æžãƒ‘ッケージをã¾ã¨ã‚ã¦ã¿ã‚‹ - æ°—ã®å‘ãã¾ã¾ã«æ›¸ãã‹ã‘ã§ã™â€¥ä¸‹æ›¸ãã§ä¿å˜ã™ã‚‹ã¨çµå±€å…¬é–‹ã—ãªã„ã“ã¨ãŒå¤šç™ºã™ã‚‹ã®ã§ã€‚ ã¾ãŸæ¥é€±ã«æ”¹è¨‚ã™ã‚‹ã¤ã‚‚り。 目的・動機 今回ã¯æ™®æ®µè‡ªåˆ†ãŒä½¿ã£ã¦ã„ãªã„プラットフォーム㮠CGH マイクãƒã‚¢ãƒ¬ã‚¤ã‚’è§£æž & 自分ã®å®Ÿé¨“データã¨æ¯”較ã™ã‚‹ãŸã‚ã«ã€ä»–社ã®ãƒ—ラットフォームを解æžã™ã‚‹ãŸã‚ã®ãƒ„ール (パッケージ) ã‚’ã“ã“ã«é›†ã‚ã¦ãŠã *1。 対象ã¨ã™ã‚‹ã®ã¯ BAC ã¨ã‚¢ã‚¸ãƒ¬ãƒ³ãƒˆç¤¾è£½ã® CGH アレイ。# ã ã£ãŸã‘ã© Affy ã¨å…±ç”¨ã®ã‚‚ã®ã‚‚ã‚ã‚‹ 背景 今やã£ã¦ã„ã‚‹ç ”ç©¶ã§ã¯ Affymetrix 社製㮠GenomeWideSNP 6.0 array ã¨ã„ã†ã‚¢ãƒ¬ã‚¤ã‚’用ã„ã¦æŸ“色体ã®æ§‹é€ 異常を解æžã—ã¦ã„る。 ã¾ãŸæœ€è¿‘ã«ãªã£ã¦å„種ã®ç²¾ç¥žç–¾æ‚£ã§å¤šãã®æŸ“è‰²ä½“æ§‹é€ ç•°å¸¸ãŒå ±å‘Šã•ã‚Œã¾ãã£ã¦ã„ã‚‹*2。ãã—ã¦ã“れらデータã¯è«–æ–‡ã§ç™ºè¡¨ã•ã‚Œã‚‹ã¨ã¨ã‚‚ã« NCBI GEO ã§ã‚‚利用å¯èƒ½ã«ãªã£ã¦ã„ã‚‹ (ã‚‚ã®ã‚‚ã‚ã‚‹)。 ã“ã“ã‹ã‚‰ãƒ‘ッケージãŸã¡ cghM
ADaCGH: analysis of data from aCGH
GLAD
CGHPRO – A comprehensive data analysis tool for array CGH
Scientific Labs / Programs
IntegraGen.com | IntegraChip™ BAC arrays
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