分子軌道のcubeファイルをPyMOL上で開く : Ag++

分子軌道のcubeファイルをPyMOL上で開く : Ag++

2015年08月23日04:59 カテゴリ 分子軌道のcubeファイルをPyMOL上で開く この記事の内容はQiitaにてアッ...概要を表示 2015年08月23日04:59 カテゴリ 分子軌道のcubeファイルをPyMOL上で開く この記事の内容はQiitaにてアップデートしました。 PyMOLで量子化学計算ソフトGaussianのcubeファイルを開いて分子軌道を表示する方法 PyMOLはVMDとまでは行きませんが、様々なファイルの可視化にも対応しています。 今回紹介するのは、Gaussian 09などで計算された分子の分子軌道（molecular orbital）をPyMOL上で表示させるテクニックです。 GaussViewやVMDなどの他のソフトを用いて可視化してもよいのですが、これを使うとこれらよりもはるかにきれいに表示できるのが売りです。PyMOL公式ページを見ると確かに分子軌道の表示の例が示されているので、できるんだろうと思って色々トライしてみたのですが、後述の仕様により少しそれを行うのに苦労しました。 その時のエ

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