コンビニのマルチコピー機でマイナンバーカードで印鑑登録証明書を発行しようとしたのですが、表示が出ないのは役所に印鑑を登録してないと言う事でしょうか？

1. 自治体によって、対応していない証明書があります。 印鑑登録証明書がコンビニ交付に対応していない自治体であれば 発行できません。役所のみとなります。 2. 印鑑登録は自治体・役所で登録申請する必要があります。 自動でなっているものでもないし、大抵は親がやっていることもないです。 印鑑証明が必要となるのはなにかの契約 自動車を買ったり、不動産の取引等に必要ですが 逆にそれらがない限りは「登録していない」ことがほとんどです。 また 印鑑登録は自治体毎に登録が必要です。 引っ越しをして自治体が変わる、住民票が移動されると無効になります。 印鑑を役所に登録したものが「実印」となり 印鑑登録証明書が発行できるようになります。

登録をしていないか、市区町村がサービスの提供していないか

https://www.lg-waps.go.jp/01-04.html 住民票のある市区町村が対応していないためと思われます。