SRA Toolkitを使ってsraファイルからfastqファイルに変換する(更新版) - Wolfeyes Bioinformatics beta

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sayamatcher “久しぶりにfastq-dumpを使ったら少し仕様が変わっていたのでメモ.だいぶ前に別の場所で書いた記事は,既に古くなってしまっている.何もせず記事を放置しておくのも申し訳ないし….”

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SRA Toolkitを使ってsraファイルからfastqファイルに変換する(更新版) - Wolfeyes Bioinformatics beta

久しぶりにfastq-dumpを使ったら少し仕様が変わっていたのでメモ．だいぶ前に別の場所で書いた記事は，... 久しぶりにfastq-dumpを使ったら少し仕様が変わっていたのでメモ．だいぶ前に別の場所で書いた記事は，既に古くなってしまっている．何もせず記事を放置しておくのも申し訳ないし，どうやらfastq-dumpでググると上位にくるようなので，ここいらで更新しておかないと…． (deprecated) Wolf Ears » SRA Toolkitを使ってsraファイルからfastqファイルに変換する SRA Toolkitのインストール sraからfastqに変換するプログラムは，SRA Toolkitの中にあるfastq-dumpを使う．まずはNCBIのサイトからOS環境に合わせてコンパイルされたSRA Toolkitをダウンロードしてインストールする． Software : Software : Sequence Read Archive : NCBI/NLM/NIH コンパイルされたバイ

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sayamatcher2015/06/24

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