Stanの関数を使ってRを拡張して高速化する - StatModeling Memorandum

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Stanの関数を使ってRを拡張して高速化する - StatModeling Memorandum

（C++に自動で変換される）Stanの関数を使ってRを拡張できる機能が、Stan/RStanの2.16で実装開始されて2... （C++に自動で変換される）Stanの関数を使ってRを拡張できる機能が、Stan/RStanの2.16で実装開始されて2.17でほぼ完成しました。Rを高速化するためにC++（とRcpp）はあまり書きたくないけれど、Stanの関数なら書いてもいいよという僕得な機能です。この記事ではその方法を簡単に紹介します。元にした資料はRStanの開発者であるBenさんがStanCon2018で発表したこちらの資料です。ここでは例として、以下の2つの関数をRで使えるようにしましょう。 1) 機械学習分野でおなじみのlog_sum_exp関数引数はN個の正の実数 2) データにemax modelという曲線をあてはめた場合の対数尤度を返す関数引数はデータ（N個のXとYのペア）とパラメータの値手順は簡単で以下だけです。 functionsブロックだけ書いたstanファイルを用意する R側でrstan

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kame_032019/11/08
horihorio2018/01/19

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