Das Transmissionselektronenmikroskop zur Analyse von Gewebsschnitten und Proteinproben ist eine weitere Forschungsinfrastruktur, die durch Hochschulraumstrukturmittel – Programm des Bundesministeriums für Bildung, Wissenschaft und Forschung – finanziert wurde. Angewandt wird diese Technologie, um in das Innerste von Zellen, Geweben bzw. Tumoren zu blicken. Der Einsatz von dreidimensionaler Elektronenmikroskopie ermöglicht neue Einblicke in verschiedene Zellorganelle, wodurch funktionelle Zusammenhänge ultrastrukturell visualisiert werden und dadurch die Möglichkeiten der medizinischen Intervention wie z.B. in der Tumorbiologie nachvollziehbar wird.