Вінкулін

Вінкулін
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1RKC, 1RKE, 1SYQ, 1TR2, 2GWW, 2IBF, 3H2U, 3H2V, 3MYI, 3TJ5, 3TJ6, 3VF0, 4DJ9, 4EHP, 1YDI, 2HSQ, 3RF3, 3S90, 4LN2, 4LNP, 4PR9, 3JBK
Ідентифікатори
Символи	VCL, CMD1W, CMH15, HEL114, MV, Mvinculin
Зовнішні ІД	OMIM: 193065 MGI: 98927 HomoloGene: 7594 GeneCards: VCL
Пов'язані генетичні захворювання
dilated cardiomyopathy 1W, hypertrophic cardiomyopathy 15, гіпертрофічна кардіоміопатія
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-catenin binding • dystroglycan binding • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • alpha-catenin binding • ubiquitin protein ligase binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular vesicle • гіалоплазма • outer dense plaque of desmosome • мембрана • cell-cell junction • focal adhesion • cell-substrate junction • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • inner dense plaque of desmosome • terminal web • extracellular region • міжклітинні контакти • brush border • actin cytoskeleton • zonula adherens • membrane raft • fascia adherens • costamere • цитоскелет • екзосома • podosome • secretory granule lumen • specific granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • Сарколема Біологічний процес • regulation of cell migration • м'язове скорочення • adherens junction assembly • epithelial cell-cell adhesion • platelet degranulation • morphogenesis of an epithelium • адгезія клітин • negative regulation of cell migration • protein localization to cell surface • axon extension • cell-matrix adhesion • platelet aggregation • apical junction assembly • lamellipodium assembly • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7414	22330
Ensembl	ENSG00000035403	ENSMUSG00000021823
UniProt	P18206	Q64727
RefSeq (мРНК)	NM_003373 NM_014000	NM_009502
RefSeq (білок)	NP_003364 NP_054706	NP_033528
Локус (UCSC)	Хр. 10: 74 – 74.12 Mb	Хр. 14: 20.98 – 21.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Вінкулін (англ. Vinculin) – білок, який кодується геном VCL, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 134 амінокислот, а молекулярна маса — 123 799.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPVFHTRTIE		SILEPVAQQI		SHLVIMHEEG		EVDGKAIPDL		TAPVAAVQAA
VSNLVRVGKE		TVQTTEDQIL		KRDMPPAFIK		VENACTKLVQ		AAQMLQSDPY
SVPARDYLID		GSRGILSGTS		DLLLTFDEAE		VRKIIRVCKG		ILEYLTVAEV
VETMEDLVTY		TKNLGPGMTK		MAKMIDERQQ		ELTHQEHRVM		LVNSMNTVKE
LLPVLISAMK		IFVTTKNSKN		QGIEEALKNR		NFTVEKMSAE		INEIIRVLQL
TSWDEDAWAS		KDTEAMKRAL		ASIDSKLNQA		KGWLRDPSAS		PGDAGEQAIR
QILDEAGKVG		ELCAGKERRE		ILGTCKMLGQ		MTDQVADLRA		RGQGSSPVAM
QKAQQVSQGL		DVLTAKVENA		ARKLEAMTNS		KQSIAKKIDA		AQNWLADPNG
GPEGEEQIRG		ALAEARKIAE		LCDDPKERDD		ILRSLGEISA		LTSKLADLRR
QGKGDSPEAR		ALAKQVATAL		QNLQTKTNRA		VANSRPAKAA		VHLEGKIEQA
QRWIDNPTVD		DRGVGQAAIR		GLVAEGHRLA		NVMMGPYRQD		LLAKCDRVDQ
LTAQLADLAA		RGEGESPQAR		ALASQLQDSL		KDLKARMQEA		MTQEVSDVFS
DTTTPIKLLA		VAATAPPDAP		NREEVFDERA		ANFENHSGKL		GATAEKAAAV
GTANKSTVEG		IQASVKTARE		LTPQVVSAAR		ILLRNPGNQA		AYEHFETMKN
QWIDNVEKMT		GLVDEAIDTK		SLLDASEEAI		KKDLDKCKVA		MANIQPQMLV
AGATSIARRA		NRILLVAKRE		VENSEDPKFR		EAVKAASDEL		SKTISPMVMD
AKAVAGNISD		PGLQKSFLDS		GYRILGAVAK		VREAFQPQEP		DFPPPPPDLE
QLRLTDELAP		PKPPLPEGEV		PPPRPPPPEE		KDEEFPEQKA		GEVINQPMMM
AARQLHDEAR		KWSSKPGIPA		AEVGIGVVAE		ADAADAAGFP		VPPDMEDDYE
PELLLMPSNQ		PVNQPILAAA		QSLHREATKW		SSKGNDIIAA		AKRMALLMAE
MSRLVRGGSG		TKRALIQCAK		DIAKASDEVT		RLAKEVAKQC		TDKRIRTNLL
QVCERIPTIS		TQLKILSTVK		ATMLGRTNIS		DEESEQATEM		LVHNAQNLMQ
SVKETVREAE		AASIKIRTDA		GFTLRWVRKT		PWYQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sun N., Critchley D.R., Paulin D., Li Z., Robson R.M. (2008). Human alpha-synemin interacts directly with vinculin and metavinculin. Biochem. J. 409: 657—667. PMID 18028034 DOI:10.1042/BJ20071188
• Le Clainche C., Dwivedi S.P., Didry D., Carlier M.F. (2010). Vinculin is a dually regulated actin filament barbed end-capping and side-binding protein. J. Biol. Chem. 285: 23420—23432. PMID 20484056 DOI:10.1074/jbc.M110.102830
• Janssen M.E., Liu H., Volkmann N., Hanein D. (2012). The C-terminal tail domain of metavinculin, vinculin's splice variant, severs actin filaments. J. Cell Biol. 197: 585—593. PMID 22613835 DOI:10.1083/jcb.201111046
• Izard T., Vonrhein C. (2004). Structural basis for amplifying vinculin activation by talin. J. Biol. Chem. 279: 27667—27678. PMID 15070891 DOI:10.1074/jbc.M403076200
• Vasile V.C., Ommen S.R., Edwards W.D., Ackerman M.J. (2006). A missense mutation in a ubiquitously expressed protein, vinculin, confers susceptibility to hypertrophic cardiomyopathy. Biochem. Biophys. Res. Commun. 345: 998—1003. PMID 16712796 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.04.151

Див. також

• Хромосома 10