NEFM

NEFM
Ідентифікатори
Символи	NEFM, NEF3, NF-M, NFM, neurofilament, medium polypeptide, neurofilament medium, neurofilament medium chain
Зовнішні ІД	OMIM: 162250 MGI: 97314 HomoloGene: 38041 GeneCards: NEFM
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity Клітинна компонента • neurofibrillary tangle • аксон • Проміжні філаменти • neurofilament • intermediate filament cytoskeleton Біологічний процес • neurofilament bundle assembly • axon development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4741	18040
Ensembl	ENSG00000104722	ENSMUSG00000022054
UniProt	P07197	P08553
RefSeq (мРНК)	NM_005382 NM_001105541	NM_008691
RefSeq (білок)	NP_001099011 NP_005373	NP_032717
Локус (UCSC)	Хр. 8: 24.91 – 24.92 Mb	Хр. 14: 68.32 – 68.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NEFM (англ. Neurofilament medium) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 916 амінокислот, а молекулярна маса — 102 472.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSYTLDSLGN		PSAYRRVTET		RSSFSRVSGS		PSSGFRSQSW		SRGSPSTVSS
SYKRSMLAPR		LAYSSAMLSS		AESSLDFSQS		SSLLNGGSGP		GGDYKLSRSN
EKEQLQGLND		RFAGYIEKVH		YLEQQNKEIE		AEIQALRQKQ		ASHAQLGDAY
DQEIRELRAT		LEMVNHEKAQ		VQLDSDHLEE		DIHRLKERFE		EEARLRDDTE
AAIRALRKDI		EEASLVKVEL		DKKVQSLQDE		VAFLRSNHEE		EVADLLAQIQ
ASHITVERKD		YLKTDISTAL		KEIRSQLESH		SDQNMHQAEE		WFKCRYAKLT
EAAEQNKEAI		RSAKEEIAEY		RRQLQSKSIE		LESVRGTKES		LERQLSDIEE
RHNHDLSSYQ		DTIQQLENEL		RGTKWEMARH		LREYQDLLNV		KMALDIEIAA
YRKLLEGEET		RFSTFAGSIT		GPLYTHRPPI		TISSKIQKPK		VEAPKLKVQH
KFVEEIIEET		KVEDEKSEME		EALTAITEEL		AVSMKEEKKE		AAEEKEEEPE
AEEEEVAAKK		SPVKATAPEV		KEEEGEKEEE		EGQEEEEEED		EGAKSDQAEE
GGSEKEGSSE		KEEGEQEEGE		TEAEAEGEEA		EAKEEKKVEE		KSEEVATKEE
LVADAKVEKP		EKAKSPVPKS		PVEEKGKSPV		PKSPVEEKGK		SPVPKSPVEE
KGKSPVPKSP		VEEKGKSPVS		KSPVEEKAKS		PVPKSPVEEA		KSKAEVGKGE
QKEEEEKEVK		EAPKEEKVEK		KEEKPKDVPE		KKKAESPVKE		EAVAEVVTIT
KSVKVHLEKE		TKEEGKPLQQ		EKEKEKAGGE		GGSEEEGSDK		GAKGSRKEDI
AVNGEVEGKE		EVEQETKEKG		SGREEEKGVV		TNGLDLSPAD		EKKGGDKSEE
KVVVTKTVEK		ITSEGGDGAT		KYITKSVTVT		QKVEEHEETF		EEKLVSTKKV
EKVTSHAIVK		EVTQSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Myers M.W., Lazzarini R.A., Lee V.M.-Y., Schlaepfer W.W., Nelson D.L. (1987). The human mid-size neurofilament subunit: a repeated protein sequence and the relationship of its gene to the intermediate filament gene family. EMBO J. 6: 1617—1626. PMID 3608989

Див. також

• Хромосома 8