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Rひとりアドベントカレンダー22日目です。終盤に差し掛かってまいりました。 さて、国内の臨床試験はUMI... Rひとりアドベントカレンダー22日目です。終盤に差し掛かってまいりました。 さて、国内の臨床試験はUMIN-CTRに登録するようになっている(特定臨床研究はjRCTだったりするが)。 そしてUMIN-CTRはスナップショットとして登録情報をCSVで公開している。 https://www.umin.ac.jp/ctr/csvdata.html 列名が2段になっているのでとりあえず1行目はスキップして2行目を列名として読み込むようにする。 library(readr) ctr <- read_csv("https://upload.umin.ac.jp/ctr_csv/ctr_data_j.csv.gz", skip = 1) ただし、1行目とひもづけることでユニークになる列名も多数あるようで列名が重複してるぜというメッセージが出るので注意。 ちゃんと分析に使いたい場合は自分で列名を綺麗にした