こうぞう‐せいぶつがく〔コウザウ‐〕【構造生物学】
構造生物学
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2024/03/03 05:30 UTC 版)
構造生物学(こうぞうせいぶつがく、英: structural biology)とは、生物を形作る巨大な生体高分子、特にタンパク質や核酸の立体構造を研究する生物学の一分野[1]。X線または電子線結晶学、NMR、クライオ電子顕微鏡などの技術を用いる。
- ^ Banaszak, Leonard J. (2000) (英語). Foundations of Structural Biology. Burlington: Elsevier. ISBN 9780080521848
- ^ “タンパク3000 [生命科学系主要プロジェクト一覧]”. togodb.biosciencedbc.jp. 国立研究開発法人科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター. 2020年7月30日閲覧。
- ^ Yokoyama, Shigeyuki; Terwilliger, Thomas C.; Kuramitsu, Seiki; Moras, Dino; Sussman, Joel L. (2007-01-04). “RIKEN aids international structural genomics efforts” (英語). Nature 445 (7123): 21. doi:10.1038/445021a. ISSN 1476-4687. PMID 17203040 .
- ^ Yonekura, Koji; Kato, Kazuyuki; Ogasawara, Mitsuo; Tomita, Masahiro; Toyoshima, Chikashi (2015-03-17). “Electron crystallography of ultrathin 3D protein crystals: Atomic model with charges”. Proceedings of the National Academy of Sciences 112 (11): 3368–3373. doi:10.1073/pnas.1500724112. PMC 4372003. PMID 25730881 .
- ^ Jumper, John; Evans, Richard; Pritzel, Alexander; Green, Tim; Figurnov, Michael; Ronneberger, Olaf; Tunyasuvunakool, Kathryn; Bates, Russ et al. (2021-08). “Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold” (英語). Nature 596 (7873): 583–589. doi:10.1038/s41586-021-03819-2. ISSN 1476-4687. PMC 8371605. PMID 34265844 .
- ^ Nango, Eriko; Royant, Antoine; Kubo, Minoru; Nakane, Takanori; Wickstrand, Cecilia; Kimura, Tetsunari; Tanaka, Tomoyuki; Tono, Kensuke et al. (2016-12-23). “A three-dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin” (英語). Science 354 (6319): 1552–1557. doi:10.1126/science.aah3497. ISSN 0036-8075 .
- ^ Oda, Kazumasa; Nomura, Takashi; Nakane, Takanori; Yamashita, Keitaro; Inoue, Keiichi; Ito, Shota; Vierock, Johannes; Hirata, Kunio et al. (2021-03-23). “Time-resolved serial femtosecond crystallography reveals early structural changes in channelrhodopsin” (英語). eLife 10: e62389. doi:10.7554/eLife.62389. ISSN 2050-084X. PMC 7987342. PMID 33752801 .
- ^ Watson, J. D.; Crick, F. H. (1953-04-25). “Molecular structure of nucleic acids; a structure for deoxyribose nucleic acid”. Nature 171 (4356): 737–738. doi:10.1038/171737a0. ISSN 0028-0836. PMID 13054692 .
- ^ Wilkins, M. H. F.; Stokes, A. R.; Wilson, H. R. (1953-04-25). “Molecular structure of deoxypentose nucleic acids”. Nature 171 (4356): 738–740. doi:10.1038/171738a0. ISSN 0028-0836. PMID 13054693 .
- ^ Abrahams, Jan Pieter; Leslie, Andrew G. W.; Lutter, René; Walker, John E. (1994-08). “Structure at 2.8 Â resolution of F1-ATPase from bovine heart mitochondria” (英語). Nature 370 (6491): 621–628. doi:10.1038/370621a0. ISSN 1476-4687 .
- ^ Ban, N. (2000-08-11). “The Complete Atomic Structure of the Large Ribosomal Subunit at 2.4 A Resolution”. Science 289 (5481): 905–920. doi:10.1126/science.289.5481.905 .
- ^ Schluenzen, Frank; Tocilj, Ante; Zarivach, Raz; Harms, Joerg; Gluehmann, Marco; Janell, Daniela; Bashan, Anat; Bartels, Heike et al. (2000-09). “Structure of Functionally Activated Small Ribosomal Subunit at 3.3 Å Resolution” (英語). Cell 102 (5): 615–623. doi:10.1016/S0092-8674(00)00084-2 .
- ^ Wimberly, Brian T.; Brodersen, Ditlev E.; Clemons, William M.; Morgan-Warren, Robert J.; Carter, Andrew P.; Vonrhein, Clemens; Hartsch, Thomas; Ramakrishnan, V. (2000-09). “Structure of the 30S ribosomal subunit” (英語). Nature 407 (6802): 327–339. doi:10.1038/35030006. ISSN 0028-0836 .
- ^ Deisenhofer, J.; Epp, O.; Miki, K.; Huber, R.; Michel, H. (1985-12). “Structure of the protein subunits in the photosynthetic reaction centre of Rhodopseudomonas viridis at 3Å resolution” (英語). Nature 318 (6047): 618–624. doi:10.1038/318618a0. ISSN 1476-4687 .
- ^ Tsukihara, T.; Aoyama, H.; Yamashita, E.; Tomizaki, T.; Yamaguchi, H.; Shinzawa-Itoh, K.; Nakashima, R.; Yaono, R. et al. (1996-05-24). “The Whole Structure of the 13-Subunit Oxidized Cytochrome c Oxidase at 2.8 A” (英語). Science 272 (5265): 1136–1144. doi:10.1126/science.272.5265.1136. ISSN 0036-8075 .
- ^ Rasmussen, Søren G. F.; DeVree, Brian T.; Zou, Yaozhong; Kruse, Andrew C.; Chung, Ka Young; Kobilka, Tong Sun; Thian, Foon Sun; Chae, Pil Seok et al. (2011-09). “Crystal structure of the β2 adrenergic receptor–Gs protein complex” (英語). Nature 477 (7366): 549–555. doi:10.1038/nature10361. ISSN 1476-4687. PMC 3184188. PMID 21772288 .
- ^ Murata, Kazuyoshi; Mitsuoka, Kaoru; Hirai, Teruhisa; Walz, Thomas; Agre, Peter; Heymann, J. Bernard; Engel, Andreas; Fujiyoshi, Yoshinori (2000-10). “Structural determinants of water permeation through aquaporin-1” (英語). Nature 407 (6804): 599–605. doi:10.1038/35036519. ISSN 1476-4687 .
- ^ Doyle, D. A. (1998-04-03). “The Structure of the Potassium Channel: Molecular Basis of K+ Conduction and Selectivity”. Science 280 (5360): 69–77. doi:10.1126/science.280.5360.69 .
- ^ Landau, Ehud M.; Rosenbusch, Jürg P. (1996-12-10). “Lipidic cubic phases: A novel concept for the crystallization of membrane proteins”. Proceedings of the National Academy of Sciences 93 (25): 14532–14535. doi:10.1073/pnas.93.25.14532. PMC 26167. PMID 8962086 .
- ^ Hirata, Kunio; Yamashita, Keitaro; Ueno, Go; Kawano, Yoshiaki; Hasegawa, Kazuya; Kumasaka, Takashi; Yamamoto, Masaki (2019-02-01). “ZOO : an automatic data-collection system for high-throughput structure analysis in protein microcrystallography”. Acta Crystallographica Section D Structural Biology 75 (2): 138–150. doi:10.1107/S2059798318017795. ISSN 2059-7983. PMC 6400253. PMID 30821703 .
- ^ Yamashita, K.; Hirata, K.; Yamamoto, M. (2018-05-01). “KAMO: towards automated data processing for microcrystals” (英語). Acta Crystallographica Section D: Structural Biology 74 (5): 441–449. doi:10.1107/S2059798318004576. ISSN 2059-7983. PMC 5930351. PMID 29717715 .
構造生物学
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/11/09 18:20 UTC 版)
「Berkeley Open Infrastructure for Network Computing」の記事における「構造生物学」の解説
Docking@Homeタンパク質のリガンドを探索、および探索方法そのものの新規開拓。 GPUGRIDCUDA対応のGPUやLinuxを導入したプレイステーション3を用いて分子動力学に基づくシミュレーションを行う。 POEM@home(英語版)タンパク質構造予測。 proteins@home(英語版)タンパク質構造予測。 Rosetta@homeタンパク質構造予測。 RALPH@homeRosetta@home次期バージョンのαテスト。 SIMAPタンパク質の相似性データベースの構築。 The Lattice Project(英語版)タンパク質構造予測、ほか分子生物学全般。
※この「構造生物学」の解説は、「Berkeley Open Infrastructure for Network Computing」の解説の一部です。
「構造生物学」を含む「Berkeley Open Infrastructure for Network Computing」の記事については、「Berkeley Open Infrastructure for Network Computing」の概要を参照ください。
「構造生物学」の例文・使い方・用例・文例
構造生物学と同じ種類の言葉
固有名詞の分類
- 構造生物学のページへのリンク