suffix arrayæ›´æ–°å±¥æ´ 2004/01/07 　O(N) æ§‹ç¯‰ã‚¢ãƒ«ã‚´ãƒªã‚ºãƒ ä¸‰ç¨®è¿½åŠ ï¼ˆKo &Alulu, Kim & al., Karkkainen & Sanders) Suffix Arrayã¯ã€æœ€è¿‘注目を集ã‚ã¦ã„ã‚‹ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿æ§‹é€ ã§ã™ã€‚ãã®ç†ç”±ã¨ã—ã¦ã€ (1)大è¦æ¨¡ãªãƒ‡ãƒ¼ã‚¿ã«å¯¾ã—ã¦ã€é«˜é€Ÿã«æ¤œç´¢ã€æƒ…å ±æŠ½å‡ºã‚’è¡Œã†ã“ã¨ãŒã§ãã‚‹ (2)BWTã¨ã—ã¦ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿åœ§ç¸®ã«ç”¨ã„ã‚‹ã“ã¨ãŒã§ãる。 ã“ã¨ãŒæŒ™ã’られã¾ã™ã€‚(1)ã«é–¢ã—ã¦ã¯è‡ªç„¶è¨€èªžå‡¦ç†ã«ãŠã„ã¦ã€è†¨å¤§ãªé‡ã®ã‚³ãƒ¼ãƒ‘スã‹ã‚‰æƒ…å ±ï¼ˆä¾‹ãˆã°ã€å˜èªžã®å‡ºç¾å›žæ•°ãªã©ï¼‰ã‚’調ã¹ã‚‹ã¨ãã«ã«Suffix Arrayを用ã„ã‚‹ã¨éžå¸¸ã«é«˜é€Ÿã«æ±‚ã‚ã‚‹ã“ã¨ãŒã§ãã¾ã™ã€‚ 膨大ãªé‡ã®ã‚³ãƒ¼ãƒ‘スã«åŸºã¥ã„ãŸè‡ªç„¶è¨€èªžå‡¦ç†ãŒç››ã‚“ã«ãªã£ã¦ãã¦ã„る今ã€Suffix ArrayãŒæ³¨ç›®ã‚’集ã‚ã¦ã„ã¾ã™ã€‚ ã¾ãŸã€ã‚²ãƒŽãƒ æƒ…å ±ã‚’èª¿ã¹ã‚‹ãƒã‚¤ã‚ªã‚¤ãƒ³ãƒ•ã‚©ãƒžãƒ†ã‚£ã‚¯ã‚¹ã«ãŠã„ã¦ã‚‚ã€ã“ã“ã®é…列ã¨ä¼¼ã¦ã„る部分（例ãˆã°CCAG）を調ã¹ã‚‹ã¨ã„ã£ãŸå ´åˆ
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