はじめに 専門家としてのアイデンティティ 分野の雰囲気の変化 コモディティ化と専門家の役割の低下 商業化・特許・ブラックボックス シェアの低下 計算資源の不足 新しい IT 技術を習得できない 小回りがきかない 同僚や分野の関心との乖離 他人事になってしまった 自分の存在意義を信じられない 今後の方針 可能性 1: 日本の電顕施設での解析支援とその問題 可能性 2: 電顕施設ではなく(生)化学系グループへ所属する 可能性 3: 仕事だと割り切って企業に行く おわりに 追記とコメント返信 変更履歴 はじめに 筆者*1は構造生物学(X 線回折と電子顕微鏡単粒子解析)のためのプログラム開発とデータ処理を専門としている。昨年、英国の研究機関にて任期なしの investigator scientist ポストに昇進し、Nature に筆頭著者として論文を出し、年間被引用数 1850 以上、h-ind

朝起きて、ツイッターなど眺めていると、とんでもないニュースが飛び込んでくる。社会性クモの個性研究の第一人者であるところのPruitt氏の論文に不正なデータがあることがわかり、論文の取り下げが生じており、それが下手すると一本や二本に留まらず（現在は二本取り下げ）、大規模な撤回が生じる可能性が出てきているとのこと。 www.sciencemag.org げげげげ、クモの個性の話は「クモのイト」で一章割いて書いている大事なテーマ。Pruitt氏の仕事もめっちゃ面白いのでいくつか紹介している。 クモのイト 作者:中田兼介 出版社/メーカー: ミシマ社 発売日: 2019/09/26 メディア: 単行本（ソフトカバー） で、撤回された論文がなにか見てみると大当たり。その個性の章でとりあげていた社会的ニッチ構築の話であった。で、いろいろ調べてみると、撤回された論文の第一著者が、おかしなデータを発見して

学術論文の質の定量的評価の指標として被引用数、つまり他の学術論文に引用された回数がよく使われます。多く引用された論文は、それだけ重要だという考えです。まさにウェブの記事のリンク数とか閲覧数とか様々な人気投票のようなものですね。さらに論文の集合、例えば同一論文誌に掲載された論文、同一人の書いた論文についての評価の指標としてインパクトファクター(impact factor、IF)というものが考案されました。1955年に生まれたこのリバイアサンは考案者の手をも離れて、まるで信用格付けのごとくに研究者の人生をも左右しかねないまでに成長しています。 IF値は本来は論文誌の評価を意図したものであり、IF値が高い論文誌はそれだけ多くの研究者に興味を持って読まれていることを意味します。なので論文を投稿しようとする者は、より多くの読者に読んでほしくて、なるべく高いIF値の論文誌に投稿しようとします。論文誌の

こんにちわ、株式会社NAMの中野哲平です。 この世に存在する全ての薬は「本当に有効であるか？」という臨床研究を行った上で販売されます。 ということは「有効である」と判断することは非常に大事です。 判断材料として「偏りのない一定数のサンプルで交絡因子がないような環境で統計学の一定基準を満たして偶然に起こり得ない有効性か？」というような疑問に答えねばなりません。 #臨床試験には、1期から3期の試験があります。ヒトを対象とした試験ですので、倫理的にも科学的にも、厳格なルールのもとに実施しなければなりません。 しかし疑問に思いませんか？ 抗がん剤などでは「この薬は効く人と効かない人がいる」と平気で言っている人がいます。それって腫瘍に多様性がある以前に、「その薬が効果がある」という検証が甘すぎる可能性があると思いませんか？ また統計学って恐ろしいですよ。有意の判定が5%で行なっている現代において、1

このブログは、こちらのサイトへ引っ越し中です。 http://wagamamakagakusha.hatenablog.com 「私は教室の若い人に優れた研究者になるための６つの「C」を説いている。すなわち、好奇心 (curiosity) を大切にして、勇気（courage）を持って困難な問題に挑戦すること（challenge）。必ずできるという自信（confidence）を持って、全精力を集中（concentration）し、そして諦めずに継続すること（continuation）。その中でも最も重要なのは、curiosity, challenge, continuation の３Cである。これが凡人でも優れた独創的と言われる研究を仕上げるための要素であると私は考える。」 （ 「独創的研究への近道：オンリーワンをめざせ」本庶佑 ） http://www2.mfour.med.kyoto-u

第９回ニコニコ学会データ研究会のLTで発表したスライドです。 データ研究会のイベントページはこちら http://niconicodatasig9.peatix.com/?lang=ja また、当日の内容はこちらのtogetterを参照下さい https://togetter.com/li/1073090Read less

 短期集中連載［全3回］ オバマケアは米国の医療に何をもたらしたのか? ■第2回　オバマケアの「デザイン」 津川 友介（米国ハーバード公衆衛生大学院（医療政策管理学）リサーチアソシエイト） （前回からつづく） 政策が目的とする成果を達成するためには，科学的根拠に基づいた政策（Evidence-based policy）を「デザイン」することが必要不可欠である。臨床医学が病態生理とエビデンスを組み合わせるEBM（科学的根拠に基づく医療）を通じて患者の健康を最大化するように，医療政策学では理論（主に医療経済学の理論）とエビデンスを融合させること（図）で医療の質の向上や，医療費抑制をめざす。昔はデータが少なく医療政策学のエビデンスも乏しかったため，実務者の経験を基に政策をデザインするのが現実的であったのかもしれない。しかし，現在では理論もエビデンスも十分に存在するため，欧米では科学的根拠に基づ

An example graph, with 6 vertices, diameter 3, connectivity 1, and algebraic connectivity 0.722 The algebraic connectivity (also known as Fiedler value or Fiedler eigenvalue after Miroslav Fiedler) of a graph G is the second-smallest eigenvalue (counting multiple eigenvalues separately) of the Laplacian matrix of G.[1] This eigenvalue is greater than 0 if and only if G is a connected graph. This i

転職して7年が過ぎたというのを読んで気づいたんだけど、そろそろ入社後9年が経過したらしい。僕は結構長い期間をここで過ごしたことになるんだなと思った。ちょっと以前のことを振り返ってみようと思う。言うまでもないけどこれは僕の書ける範囲での個人的な感想と体験談であって会社の見解等を表しているものではない。 きっかけ わりと重要でない Borgチーム (の周辺) いつのまにやらBorgという名前を普通に言って良くなっている。嬉しい。まあ当時もぶっちゃけ、秘密だから出してないっていうよりは、単に誰もアカデミア的なキャリアに興味が無いから出してなかったんだと思う(私見)。 さて、当時Borgというかクラスタマネージメントのあたりでは、コンピュータのリソースて適当にたくさん使ってるけど、これ節約したらすっげー支出減ったりしない？みたいなのがホットで、なんかとりあえず色々な人々が色んなことをやっていた。い

サイバー救助犬、GPSとカメラつきの｢ハイテクスーツ｣で捜索状況をリアルタイムに送信2016.03.11 10:15 塚本直樹 救助犬と人がもっと協力しあえます。 その優れた嗅覚で、瓦礫の下の被災者の発見に役立ってくれる｢救助犬｣。今では災害報道などでもおなじみの存在になりました。そしてその救助犬の活動をテクノロジーでサポートすべく、カメラやGPSを搭載した｢ハイテクスーツ｣が未来科学技術共同研究センター大野和則准教授の研究グループによって開発されました。 このハイテクスーツは救助チームが捜索活動を共有するために作られました。上の動画にもあるように、救助隊（ハンドラ）のPC画面には救助犬の見ている視野とGPSによる移動の軌跡が表示されます。被災者を発見すると救助犬は吠えるのですが、それに加えてカメラからの映像と集音機器による音声でその場の状況を詳しく知ることができるのです。また、GPSデー

iPS細胞はどうやって発見されたのでしょうか？世紀の大発見なのだからとても複雑な実験がなされたと思われるかもしれませんが、実際にはとてもシンプルで美しい実験により明らかになりました。 iPadアプリ「iPSマスター」では、あなたも山中研究室の一員となって、iPS細胞を発見した時の実験を追体験できます。 さぁ、みなさん、用意はいいですか？ iPS細胞を作り出す研究に挑戦してみましょう！

2015年の8月にScience誌に衝撃的な論文が発表されました。査読付きの主要な学術誌に発表された心理学と社会科学の研究論文100件についてその結果の再現を試みたところ、同じ結果が得られたのは39％にすぎなかったというのです。2010年以降、心理学の中で研究の信頼性に関する問題がクローズアップされています。何が問題となっているのか、またそれに対してどのような対応が進められているのかを、日本でこうした問題に取り組まれている研究者の方々に話を伺いました。 取り組みのきっかけ ――こうした問題に取り組もうと思ったきっかけは何だったのでしょうか。そのときにどう思ったのかも教えてください。 池田功毅（以下、池田）： 池田功毅（いけだ・こうき）：中京大学心理学研究科・日本学術振興会特別研究員PD。主要著作・論文にShape and spatial working memory capacities

※予想以上の反響でして、下のほうで随時追記しております。 ※（2015/11/22 16:39追記）「秋の行政事業レビュー続編：「研究成果」と「科学の成果」は全く別物であることがわかった件。」を新たに書きました。 2015年11月11日、12日、13日と3日間で秋の行政事業レビューが行われました。政府の行政改革推進本部が、国の事業の検証をするやつです。 超大雑把にいうと、昔話題になった「事業仕分け」的なやつです。 その2日目、12日にはスパコンに関するレビューがありました。私はライブ配信を見ていたわけではなく、後から情報を集めたのですが、どうも引っかかることがあったので書き留めておきます。 まぁ、タイトルの通りなのですが、心臓シミュレータUT-Heartの可視化CGを「ろう人形館」のような「ものまね」だと慶應教授に批判されました。 こちらの映像をご覧下さい。4分24秒からが該当する発言です

はじめはプリオンなんて信じなかった． だって話が出来過ぎではないか．たんぱく質の1次元配列は同じでも，その折りたたみの形状が複数ある．みんながＡという折りたたみ方をしているときに，それよりちょっとだけ安定なＢという形状のものを入れると，それが自己触媒的に伝わっていき，とうとう全部がＢになってしまう． これだけで，統計物理だの非線形科学だのに興味を持っている人間にはツボとしかいいようがない．たとえば，結晶を作るときに「種」を入れると，それまで「偽りの安定状態」にあった過飽和溶液から急速に固体が出現する．こうした正のフィードバック現象は，こうした学問に携わる者の心の底に棲みついている．それが突然思ってもみなかったふうに登場したのである． しかも，プリオンには「ストレイン」という系統のようなものがいくつもあって，たとえば系統Ｂに感染すると全部が系統Ｂに，系統Ｃに感染すると全部が系統Ｃ，という風に