研究を支える拡張性の高い ワークフローツールの提案 / Proposal of highly expandable workflow tools to support research

GoogleのAI部門が開発を続けているソフトウェア「AlphaFold」。「タンパク質の折りたたみ問題」を解くためのAIプログラムとのことですが、そもそも「タンパク質の折りたたみ問題」とはいかなるもので、なぜこの問題を説くことが重要視されるのでしょうか。今回のメルマガ『週刊 Life is beautiful』では著者で世界的エンジニアとして知られる中島聡さんが、そんな疑問に対する答えを具体例を上げつつわかりやすく解説。さらに「AlphaFold」が医学の進歩に大きな影響を与える理由を紹介しています。 ※本記事のタイトルはMAG2NEWS編集部によるものです／原題：AIと医療（AlphaFold） プロフィール：中島聡（なかじま・さとし） ブロガー／起業家／ソフトウェア・エンジニア、工学修士（早稲田大学）／MBA（ワシントン大学）。NTT通信研究所／マイクロソフト日本法人／マイクロソフト

先日開催された厚生科学審議会において、日本における抗体陽性率の最新の調査結果が報告されました。 この結果からは、日本に住む約4割の人がすでに新型コロナに感染しているということが分かりました。 今回の調査結果からは他にどのようなことが分かるでしょうか？ 「抗体調査」とは？S抗体とN抗体の違いは？S抗体とN抗体（DOI:https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2022.07.012より筆者作図） 抗体とは、免疫システムによって作られるタンパク質のことであり、新型コロナウイルスに感染したりワクチン接種をすると、種々の抗体が作られます。 測定されることの多い新型コロナの抗体としてはS抗体とN抗体の2種類があり、S抗体はワクチンの標的である「スパイク蛋白（S蛋白）」の抗体でありワクチン接種をした人と感染した人のいずれも陽性になるのに対し、N抗体はウイルス遺伝子を包み込んで

3月13日からマスク着用については屋内・屋外にかかわらず個人の判断に委ねられることになります。 「ずっと外しっぱなし」「ずっと着けっぱなし」ではなく、場面や状況に応じて感染リスクを判断し、着ける・着けないを考えることが重要です。 マスク着用に際し、どういった点を考慮すべきかについて解説します。 3月13日からマスク着用は個人の判断に新型コロナの流行初期からマスクの着用については日本国内では義務ではなく、屋内での装着を「推奨」という位置づけでした。 これが明日からは「個人の判断に委ねる」ということになります。 私自身は、各自がそれぞれの場面における感染リスクを理解し、マスクを着けるべき場面、着けなくてもよい場面が適切に判断できるようになることが重要であると思いますので、こうした政府の方針はとても良いことかと思います。 ただし、全ての人が適切にマスクを着ける場面、外す場面を理解することは難しく

昨年（2022年）8月の新たながん診療連携拠点病院等の整備指針（指定要件）に基づき、本年（2023年）4月からのがん診療連携病院等を新たに指定しなおす—。 都道府県がん診療連携拠点病院は一般型49（うち一部要件が充足できず1年指定が15）、特例型2、地域がん診療連携拠点病院は一般型325（同1年指定が87）、特例型25、地域がん診療病院は一般型37（同じく1年指定9）、特例型6、特定領域がん診療連携拠点病院1となる—。 1月19日に開催された「がん診療連携拠点病院等の指定に関する検討会」（以下、指定検討会）で、こういった方針が固められました（検討会資料はこちら（厚労省サイト））。 検討会の意見を踏まえ、加藤勝信厚生労働大臣が本年度中（2023年3月末まで）に指定手続きなどを行い、この4月1日（2023年4月1日）から新たながん診療提供体制がスタートすることになります。 本稿では、全体像を眺

もうおわ(アイコン変わったよ) @R9004IhcyG1nHvr 15年以上大腸カメラをやっているわけだが、物凄く美しい吻合部をみた。すげえ、綺麗...と見惚れちゃった。これは絶対手縫いだろうなぁ、と執刀医の名前を患者さんに聞いたら、今は引退されたこの地方のゴッドハンドと名高い先生だった。 2022-11-17 16:47:01 もうおわ(アイコン変わったよ) @R9004IhcyG1nHvr その方の現役時代を知るオペ看さんが言うには 電メが触れるとモーセの十戒みたいに組織が開いて、出血もものすごく少なかったんだって。すげえなぁ。こんだけ綺麗な吻合部だもんなぁ。 2022-11-17 16:48:21 もうおわ(アイコン変わったよ) @R9004IhcyG1nHvr すごくマニアックな話だけど、開腹のLAR。 挿入して、え、吻合部どこ...???って一瞬戸惑うほどSが自然に繋がってて、ど

Published 2022/02/12 10:00 (JST) Updated 2022/06/13 10:05 (JST) 新型コロナウイルス感染症の症状がどんなものかは多く報道されているが、回復後の後遺症の実態は意外と知られていない。記者（３３歳、女性）は、感染から１年たった今も後遺症に苦しんでいる。体の痛みで座っていられずにのたうちまわり、ひどい倦怠感で日常生活がままならない時もあった。仕事も長期の休職を余儀なくされた。治療である程度は改善したものの、今も本調子にはほど遠く、再び悪化するかもしれない恐怖と闘う日々だ。 若年層は感染しても重症化しにくいからと、油断しないでほしい。コロナ感染自体はたいしたことがなくても、その後に重い後遺症に苦しむ人は多くいる。記者の体験から、その深刻さを知ってもらいたい。（共同通信＝秋田紗矢子） ▽感染判明、でもずっと軽症 コロナ感染が判明したのは昨年

新型コロナウイルスの患者が重症化するメカニズムが最近の研究で明らかになってきた。生命を脅かす重い肺炎は、自分を守るはずの免疫が過剰に働くことで起きている可能性が判明した。ウイルスは全身の臓器に侵入してさまざまな症状を引き起こすとみられ、詳しく解明できれば治療法の開発につながると期待される。（松田麻希、伊藤壽一郎） 「肺炎を起こしても軽い症状で治る場合もあるが、重篤化する人もいる。病気の仕組みがよく分かっておらず、どの人が重くなるか見極められない」 愛知医科大の森島恒雄客員教授（感染症内科学）は、治療の難しさをこう話す。悪化する場合は非常に急激で、人工呼吸器や人工心肺装置（ＥＣＭＯ）がこれほど高い比率で必要になる病気はないという。 なぜ致死的な肺炎に至るのか。量子科学技術研究開発機構理事長で免疫学が専門の平野俊夫氏らは、免疫がウイルスを打ち負かそうとするあまり過剰に働き、いわば暴走して炎症が

WHOの中国調査団 チームリードのDr. Bruce Aylwardの2時間に渡る独自記者会見。2月25日とずいぶん前のものだが、どれだけコロナが恐ろしい病気か今見ても意味があると思うので以下大事なところを抜き出して列記。この調査団によって書かれたWHO-China Joint Mission Reportも公開されている。記者会見もレポートも3月5日のコロナウィルス 怖いからもリンクしたが、多分2時間見るのはパラノイアの私くらいでしょう。 ちなみに私はこの会見を見て、コロナに対する恐怖が著しく増大し、AmazonでPPE（医療用手袋・防護服・ゴーグル）をオーダーしてしまったのだが、よく考えたら基本どこにもいかないから必要ないので、地元の病院に寄付。「なんで世界中の人がトイレットペーパー買い占めに走るのか」という疑問が世間に渦巻いているが、たぶんこれは「やばい、でも自分でできることがない」

日々のカロリー摂取量を2年間にわたって控えることで、加齢に伴う体の老化に関係があるとされる「全身酸化ストレス」が低下して体の老化が遅くなる可能性があることが、最新の研究によって明らかにされています。 Metabolic Slowing and Reduced Oxidative Damage with Sustained Caloric Restriction Support the Rate of Living and Oxidative Damage Theories of Aging https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S155041311830130X Calorie restriction trial in humans suggests benefits for age-related disease | Eure

７月３１日、大相撲の元横綱千代の富士の九重親方（６１）が東京都内の病院で死去したことが報じられました。現役時代、その技の美しさと圧倒的な強さに憧れを抱いた世代の一人として、心から哀悼の意を表します。 報道によると、九重親方は去年すい臓がんの手術を受け、その後は職務に復帰したものの、最近になって転移が見つかったとされています。 実はこの「すい臓がん」という病気は、検査や治療の技術が進歩した現代においても治癒が難しい、とても「やっかい」ながんなのです。 すい臓がんで亡くなる人は、増え続けている余り知られていないことですが、いまがんで亡くなる人は減り続けています。 亡くなる人の数自体は増え続けているのですが、それは高齢化の影響が大きく、年齢の影響を排除すると、がん全体の死亡率は年々減り続けているのです。主要ながん（胃がん、大腸がんなど）の死亡率を見ても、男女ともにおおむね横ばいか、減っています。

フリーアナウンサーの中井美穂さんがテレビ番組で病気治療のため、一時、人工肛門での生活をしていたことを告白し、注目を集めている。特に人工肛門・ぼうこうを持ちながら、仕事や学業に励む世代は「排せつ障害」への社会の理解がなかなか進まない現実に深い悩みを抱えている。現役世代の声を聞いた。 声優の真山亜子さん（57）は42歳のとき、クローン病の悪化により手術を受け、排泄のための「ストーマ」（排泄孔）を設けた。手術後数年間はとにかく苦労の連続だった。 映画の吹き替えなど、長時間の仕事のときに最も緊張した。仕事先でストーマから漏れてしまい、応急処置を求めた病院では断られ、自分でテープや脱脂綿を使って何とかしのいだこともあった。 いまも人工肛門について、あまりにも理解がない現実にぶつかることが多い。例えば、観劇ホールで、休憩時間に、どうしても緊急に対応しなくてはならず、トイレに並ぶ列を通り越して、オストメ

慶応大学医学部、iPhoneによる不整脈や脳梗塞の早期検出の臨床研究、「ResearchKit」を利用 慶応義塾大学医学部は2015年11月25日、iPhoneを活用した臨床研究を開始したと発表した。iPhoneのセンサーを活用してヘルスケアデータを収集・解析し、不整脈や脳梗塞の早期検出・予防の可能性を検証する。iPhoneユーザーは、専用アプリ「Heart & Brain」を無料ダウンロードすることで臨床研究に参加できる。 iPhoneの加速度センサーやジャイロスコープなどを用いて歩数や運動量などのヘルスケアデータを収集・解析するとともに、脳梗塞検出に役立つ簡単な運動評価検査を行う。また、Apple Watchを使えば心拍数も記録できる。収集データはプライバシーに配慮して個人が特定できない形で保存し、臨床研究データ解析以外の目的には使わないとしている。 Heart & Brainの開発に