PTPRD

PTPRD
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1X5Z, 2DLH, 2YD6, 2YD7, 4RCA
Ідентифікатори
Символи	PTPRD, HPTP, HPTPD, HPTPDELTA, PTPD, RPTPDELTA, protein tyrosine phosphatase, receptor type D, protein tyrosine phosphatase receptor type D, R-PTP-delta
Зовнішні ІД	OMIM: 601598 HomoloGene: 88669 GeneCards: PTPRD
Пов'язані генетичні захворювання
	епілепсія, ожиріння, короткозорість, синдром неспокійних ніг, цукровий діабет 2-го типу, focal epilepsy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • phosphoprotein phosphatase activity; • protein tyrosine phosphatase activity; • hydrolase activity; • signaling receptor binding; • cell adhesion molecule binding; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• екзосома; • мембрана; • integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • клітинна мембрана; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• presynaptic membrane assembly; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway; • neuron differentiation; • positive regulation of dendrite morphogenesis; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • phosphate-containing compound metabolic process; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • positive regulation of synapse assembly; • regulation of postsynaptic density assembly; • trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex; • synaptic membrane adhesion; • regulation of presynapse assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5789
	313278
	ENSG00000153707; ENSG00000282932
	ENSRNOG00000005711
	P23468; Q3KPI9
	н/д
NM_001040712; NM_001171025; NM_002839; NM_130391; NM_130392;
	NM_130393; NM_001377946; NM_001377947; NM_001377958; NM_001378058
XM_001067936; XM_003754043; XM_006225346; XM_006225347; XM_006225348;
	XM_006225349; XM_006225350; XM_006225351; XM_006225352; XM_006225353; XM_006225354; XM_006225356; XM_006225357; XM_006225358; XM_006225359; XM_006225360; XM_006225362; XM_006225363; XM_006225366; XM_006225370; XM_006225371; XM_006225372; XM_006225373; XM_006225375; XM_006225376; XM_006225377; XM_006225378; XM_006225379; XM_006225380; XM_008763819; XM_008763820; XM_008763821; XM_008763822; XM_008763823; XM_008763824; XM_008763825; XM_008763826; XM_008763827; XM_008763828; XM_008763829; XM_008763830; XM_008763831; XM_017593938; XM_017593939; XM_017593940; XM_017593941; XM_017593942; XM_017593943; XM_017593944; XM_017593945; XM_017593946; XM_017593947; XM_017593948; XM_017593949; XM_017593950; XM_017593951; XM_017593952; XM_017593953; XM_017593954; XM_017593955; XM_017593956; XM_017593957; XM_017602893; XM_017602894; XM_017602895; XM_017602896
NP_001035802; NP_001164496; NP_002830; NP_569075; NP_569076;
	NP_569077; NP_001364875; NP_001364876; NP_001364887; NP_001364987; NP_569077.2
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRD (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 912 амінокислот, а молекулярна маса — 214 760^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVHVARLLLL	LLTFFLRTDA	ETPPRFTRTP	VDQTGVSGGV	ASFICQATGD
PRPKIVWNKK	GKKVSNQRFE	VIEFDDGSGS	VLRIQPLRTP	RDEAIYECVA
SNNVGEISVS	TRLTVLREDQ	IPRGFPTIDM	GPQLKVVERT	RTATMLCAAS
GNPDPEITWF	KDFLPVDTSN	NNGRIKQLRS	ESIGGTPIRG	ALQIEQSEES
DQGKYECVAT	NSAGTRYSAP	ANLYVRELRE	VRRVPPRFSI	PPTNHEIMPG
GSVNITCVAV	GSPMPYVKWM	LGAEDLTPED	DMPIGRNVLE	LNDVRQSANY
TCVAMSTLGV	IEAIAQITVK	ALPKPPGTPV	VTESTATSIT	LTWDSGNPEP
VSYYIIQHKP	KNSEELYKEI	DGVATTRYSV	AGLSPYSDYE	FRVVAVNNIG
RGPPSEPVLT	QTSEQAPSSA	PRDVQARMLS	STTILVQWKE	PEEPNGQIQG
YRVYYTMDPT	QHVNNWMKHN	VADSQITTIG	NLVPQKTYSV	KVLAFTSIGD
GPLSSDIQVI	TQTGVPGQPL	NFKAEPESET	SILLSWTPPR	SDTIANYELV
YKDGEHGEEQ	RITIEPGTSY	RLQGLKPNSL	YYFRLAARSP	QGLGASTAEI
SARTMQSKPS	APPQDISCTS	PSSTSILVSW	QPPPVEKQNG	IITEYSIKYT
AVDGEDDKPH	EILGIPSDTT	KYLLEQLEKW	TEYRITVTAH	TDVGPGPESL
SVLIRTNEDV	PSGPPRKVEV	EAVNSTSVKV	SWRSPVPNKQ	HGQIRGYQVH
YVRMENGEPK	GQPMLKDVML	ADAQWEFDDT	TEHDMIISGL	QPETSYSLTV
TAYTTKGDGA	RSKPKLVSTT	GAVPGKPRLV	INHTQMNTAL	IQWHPPVDTF
GPLQGYRLKF	GRKDMEPLTT	LEFSEKEDHF	TATDIHKGAS	YVFRLSARNK
VGFGEEMVKE	ISIPEEVPTG	FPQNLHSEGT	TSTSVQLSWQ	PPVLAERNGI
ITKYTLLYRD	INIPLLPMEQ	LIVPADTTMT	LTGLKPDTTY	DVKVRAHTSK
GPGPYSPSVQ	FRTLPVDQVF	AKNFHVKAVM	KTSVLLSWEI	PENYNSAMPF
KILYDDGKMV	EEVDGRATQK	LIVNLKPEKS	YSFVLTNRGN	SAGGLQHRVT
AKTAPDVLRT	KPAFIGKTNL	DGMITVQLPE	VPANENIKGY	YIIIVPLKKS
RGKFIKPWES	PDEMELDELL	KEISRKRRSI	RYGREVELKP	YIAAHFDVLP
TEFTLGDDKH	YGGFTNKQLQ	SGQEYVFFVL	AVMEHAESKM	YATSPYSDPV
VSMDLDPQPI	TDEEEGLIWV	VGPVLAVVFI	ICIVIAILLY	KRKRAESDSR
KSSIPNNKEI	PSHHPTDPVE	LRRLNFQTPG	MASHPPIPIL	ELADHIERLK
ANDNLKFSQE	YESIDPGQQF	TWEHSNLEVN	KPKNRYANVI	AYDHSRVLLS
AIEGIPGSDY	VNANYIDGYR	KQNAYIATQG	SLPETFGDFW	RMIWEQRSAT
VVMMTKLEER	SRVKCDQYWP	SRGTETHGLV	QVTLLDTVEL	ATYCVRTFAL
YKNGSSEKRE	VRQFQFTAWP	DHGVPEHPTP	FLAFLRRVKT	CNPPDAGPMV
VHCSAGVGRT	GCFIVIDAML	ERIKHEKTVD	IYGHVTLMRA	QRNYMVQTED
QYIFIHDALL	EAVTCGNTEV	PARNLYAYIQ	KLTQIETGEN	VTGMELEFKR
LASSKAHTSR	FISANLPCNK	FKNRLVNIMP	YESTRVCLQP	IRGVEGSDYI
NASFIDGYRQ	QKAYIATQGP	LAETTEDFWR	MLWEHNSTIV	VMLTKLREMG
REKCHQYWPA	ERSARYQYFV	VDPMAEYNMP	QYILREFKVT	DARDGQSRTV
RQFQFTDWPE	QGVPKSGEGF	IDFIGQVHKT	KEQFGQDGPI	SVHCSAGVGR
TGVFITLSIV	LERMRYEGVV	DIFQTVKMLR	TQRPAMVQTE	DQYQFSYRAA
LEYLGSFDHY	AT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Pulido R., Krueger N.X., Serra-Pages C., Saito H., Streuli M. (1995). Molecular characterization of the human transmembrane protein-tyrosine phosphatase delta. Evidence for tissue-specific expression of alternative human transmembrane protein-tyrosine phosphatase delta isoforms. J. Biol. Chem. 270: 6722—6728. PMID 7896816 DOI:10.1074/jbc.270.12.6722
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9668 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P23468 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PTPRD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9668 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P23468 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

PTPRD

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук