LIN28A

LIN28A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CQF, 2LI8
Ідентифікатори
Символи	LIN28A, CSDD1, LIN-28, LIN28, ZCCHC1, lin-28A, lin-28 homolog A, Lin28a, LIN28A (gene), Lin-28 homolog A
Зовнішні ІД	OMIM: 611043 MGI: 1890546 HomoloGene: 32592 GeneCards: LIN28A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • translation initiation factor binding; • mRNA binding; • G-quadruplex RNA binding; • miRNA binding; • sequence-specific mRNA binding; • polysome binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • ядерце; • клітинне ядро; • ендоплазматичний ретикулум; • rough endoplasmic reticulum; • Полісома; • P-body; • cytoplasmic stress granule; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA; • germ cell development; • miRNA catabolic process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • RNA 3'-end processing; • somatic stem cell population maintenance; • negative regulation of glial cell differentiation; • positive regulation of translation; • stem cell differentiation; • positive regulation of cell proliferation involved in kidney development; • stem cell population maintenance; • pre-miRNA processing; • positive regulation of neuron differentiation; • GO:0061715 miRNA metabolic process; • Сайленсинг генів; • negative regulation of translation; • positive regulation of TOR signaling; • positive regulation of protein kinase B signaling; • cellular response to glucose stimulus; • positive regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • positive regulation of cytoplasmic translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79727
	83557
	ENSG00000131914
	ENSMUSG00000050966
	Q9H9Z2
	Q8K3Y3
	NM_024674
	NM_145833
	NP_078950
	NP_665832
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LIN28A (англ. Lin-28 homolog A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 209 амінокислот, а молекулярна маса — 22 743^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSVSNQQFA	GGCAKAAEEA	PEEAPEDAAR	AADEPQLLHG	AGICKWFNVR
MGFGFLSMTA	RAGVALDPPV	DVFVHQSKLH	MEGFRSLKEG	EAVEFTFKKS
AKGLESIRVT	GPGGVFCIGS	ERRPKGKSMQ	KRRSKGDRCY	NCGGLDHHAK
ECKLPPQPKK	CHFCQSISHM	VASCPLKAQQ	GPSAQGKPTY	FREEEEEIHS
PTLLPEAQN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як РНК-залежне заглушення генів, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Moss E.G., Tang L. (2003). Conservation of the heterochronic regulator Lin-28, its developmental expression and microRNA complementary sites. Dev. Biol. 258: 432—442. PMID 12798299 doi:10.1016/S0012-1606(03)00126-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Richards M., Tan S.-P., Tan J.-H., Chan W.-K., Bongso A. (2004). The transcriptome profile of human embryonic stem cells as defined by SAGE. Stem Cells. 22: 51—64. PMID 14688391 doi:10.1634/stemcells.22-1-51
Lee Y.S., Kim H.K., Chung S., Kim K.-S., Dutta A. (2005). Depletion of human micro-RNA miR-125b reveals that it is critical for the proliferation of differentiated cells but not for the down-regulation of putative targets during differentiation. J. Biol. Chem. 280: 16635—16641. PMID 15722555 doi:10.1074/jbc.M412247200
Wu L., Belasco J.G. (2005). Micro-RNA regulation of the mammalian lin-28 gene during neuronal differentiation of embryonal carcinoma cells. Mol. Cell. Biol. 25: 9198—9208. PMID 16227573 doi:10.1128/MCB.25.21.9198-9208.2005
Balzer E., Moss E.G. (2007). Localization of the developmental timing regulator Lin28 to mRNP complexes, P-bodies and stress granules. RNA Biol. 4: 16—25. PMID 17617744 doi:10.4161/rna.4.1.4364

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15986 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-06-13 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9H9Z2 (англ.) . Архів оригіналу за 28 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15986 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-06-13 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9H9Z2 (англ.) . Архів оригіналу за 28 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]