2014-04-01から1ヶ月間の記事一覧

Rで組み合わせ一覧を取得する

R

library(gtools) combinations(n=20,r=10,1:20) 参考 http://d.hatena.ne.jp/yusap/20130518/1368845756

igraphで多重エッジを取り除く

g 太さを変える。 g weight E(g)$weight E(g)$width=E(g)$weighthttp://kappa-bioinformatics.blogspot.jp/2011/02/gene-ontologygodb.htmlhttp://homepage3.nifty.com/kaku-chan/graphviz/chapter_005.html矢印の大きさは変えられないらしい arrow.size を…

Rでデバッグ

Rのデバッグ http://stat.biopapyrus.net/dev/debug.html エラーの原因の関数をさぐる。エラー後実行 traceback() browser() をしかける。ここからデバッグモードを入る。 f z browser() return(z) } デバックモードに入るので、 ls で参照可能な変数をみる…

Rのbs()関数の解読

Rのbs関数の解読 以下コピペ function (x, df = NULL, knots = NULL, degree = 3, intercept = FALSE, Boundary.knots = range(x)) { x <- x if (smart.mode.is("read")) { return(eval(smart.expression)) } nx <- names(x) x <- as.vector(x) nax <- is.na…