WRNIP1

WRNIP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3VHS, 3VHT
Ідентифікатори
Символи	WRNIP1, WHIP, bA420G6.2, Werner helicase interacting protein 1, WRN helicase interacting protein 1, CFAP93, FAP93
Зовнішні ІД	OMIM: 608196 MGI: 1926153 HomoloGene: 10592 GeneCards: WRNIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • Реплісома Біологічний процес • реплікація ДНК • DNA synthesis involved in DNA repair • regulation of DNA-dependent DNA replication initiation • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • процес імунної системи • DNA-dependent DNA replication • regulation of DNA repair • DNA recombination • DNA replication, Okazaki fragment processing • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56897	78903
Ensembl	ENSG00000124535	ENSMUSG00000021400
UniProt	Q96S55	Q91XU0
RefSeq (мРНК)	NM_020135 NM_130395	NM_030215
RefSeq (білок)	NP_064520 NP_569079	NP_084491
Локус (UCSC)	Хр. 6: 2.77 – 2.79 Mb	Хр. 13: 32.99 – 33.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WRNIP1 (англ. Werner helicase interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 665 амінокислот, а молекулярна маса — 72 133.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVSGPEDDP		FLSQLHQVQC		PVCQQMMPAA		HINSHLDRCL		LLHPAGHAEP
AAGSHRAGER		AKGPSPPGAK		RRRLSESSAL		KQPATPTAAE		SSEGEGEEGD
DGGETESRES		YDAPPTPSGA		RLIPDFPVAR		SSSPGRKGSG		KRPAAAAAAG
SASPRSWDEA		EAQEEEEAVG		DGDGDGDADA		DGEDDPGHWD		ADAAEAATAF
GASGGGRPHP		RALAAEEIRQ		MLQGKPLADT		MRPDTLQDYF		GQSKAVGQDT
LLRSLLETNE		IPSLILWGPP		GCGKTTLAHI		IASNSKKHSI		RFVTLSATNA
KTNDVRDVIK		QAQNEKSFFK		RKTILFIDEI		HRFNKSQQDT		FLPHVECGTI
TLIGATTENP		SFQVNAALLS		RCRVIVLEKL		PVEAMVTILM		RAINSLGIHV
LDSSRPTDPL		SHSSNSSSEP		AMFIEDKAVD		TLAYLSDGDA		RAGLNGLQLA
VLARLSSRKM		FCKKSGQSYS		PSRVLITEND		VKEGLQRSHI		LYDRAGEEHY
NCISALHKSM		RGSDQNASLY		WLARMLEGGE		DPLYVARRLV		RFASEDIGLA
DPSALTQAVA		AYQGCHFIGM		PECEVLLAQC		VVYFARAPKS		IEVYSAYNNV
KACLRNHQGP		LPPVPLHLRN		APTRLMKDLG		YGKGYKYNPM		YSEPVDQEYL
PEELRGVDFF		KQRRC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tsurimoto T., Shinozaki A., Yano M., Seki M., Enomoto T. (2005). Human Werner helicase interacting protein 1 (WRNIP1) functions as a novel modulator for DNA polymerase delta. Genes Cells. 10: 13—22. PMID 15670210 DOI:10.1111/j.1365-2443.2004.00812.x
• Bish R.A., Myers M.P. (2007). Werner helicase-interacting protein 1 binds polyubiquitin via its zinc finger domain. J. Biol. Chem. 282: 23184—23193. PMID 17550899 DOI:10.1074/jbc.M701042200

Див. також

• Хромосома 6