WDR36

WDR36
Ідентифікатори
Символи	WDR36, GLC1G, TA-WDRP, TAWDRP, UTP21, WD repeat domain 36
Зовнішні ІД	OMIM: 609669 MGI: 1917819 HomoloGene: 6536 GeneCards: WDR36
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • small-subunit processome • Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome Біологічний процес • retina homeostasis • regulation of axon extension • ribosome biogenesis • відповідь на стимул • зір • rRNA processing • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	134430	225348
Ensembl	ENSG00000134987	ENSMUSG00000038299
UniProt	Q8NI36	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_139281	NM_001110015 NM_001110016 NM_144863
RefSeq (білок)	NP_644810	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 111.09 – 111.13 Mb	Хр. 18: 32.97 – 33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WDR36 (англ. WD repeat domain 36) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 951 амінокислот, а молекулярна маса — 105 322.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCCTEGSLRK		RDSQRAPEAV		LCLQLWQRTV		PLDTLKGLGT		CFPSGPELRG
AGIAAAMERA		SERRTASALF		AGFRALGLFS		NDIPHVVRFS		ALKRRFYVTT
CVGKSFHTYD		VQKLSLVAVS		NSVPQDICCM		AADGRLVFAA		YGNVFSAFAR
NKEIVHTFKG		HKAEIHFLQP		FGDHIISVDT		DGILIIWHIY		SEEEYLQLTF
DKSVFKISAI		LHPSTYLNKI		LLGSEQGSLQ		LWNVKSNKLL		YTFPGWKVGV
TALQQAPAVD		VVAIGLMSGQ		VIIHNIKFNE		TLMKFRQDWG		PITSISFRTD
GHPVMAAGSP		CGHIGLWDLE		DKKLINQMRN		AHSTAIAGLT		FLHREPLLVT
NGADNALRIW		IFDGPTGEGR		LLRFRMGHSA		PLTNIRYYGQ		NGQQILSASQ
DGTLQSFSTV		HEKFNKSLGH		GLINKKRVKR		KGLQNTMSVR		LPPITKFAAE
EARESDWDGI		IACHQGKLSC		STWNYQKSTI		GAYFLKPKEL		KKDDITATAV
DITSCGNFAV		IGLSSGTVDV		YNMQSGIHRG		SFGKDQAHKG		SVRGVAVDGL
NQLTVTTGSE		GLLKFWNFKN		KILIHSVSLS		SSPNIMLLHR		DSGILGLALD
DFSISVLDIE		TRKIVREFSG		HQGQINDMAF		SPDGRWLISA		AMDCSIRTWD
LPSGCLIDCF		LLDSAPLNVS		MSPTGDFLAT		SHVDHLGIYL		WSNISLYSVV
SLRPLPADYV		PSIVMLPGTC		QTQDVEVSEE		TVEPSDELIE		YDSPEQLNEQ
LVTLSLLPES		RWKNLLNLDV		IKKKNKPKEP		PKVPKSAPFF		IPTIPGLVPR
YAAPEQNNDP		QQSKVVNLGV		LAQKSDFCLK		LEEGLVNNKY		DTALNLLKES
GPSGIETELR		SLSPDCGGSI		EVMQSFLKMI		GMMLDRKRDF		ELAQAYLALF
LKLHLKMLPS		EPVLLEEITN		LSSQVEENWT		HLQSLFNQSM		CILNYLKSAL
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, біогенез рибосом, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ahmad Y., Boisvert F.M., Lundberg E., Uhlen M., Lamond A.I. (2012). Systematic analysis of protein pools, isoforms, and modifications affecting turnover and subcellular localization. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.013680.01 — M111.013680.15. PMID 22002106 DOI:10.1074/mcp.M111.013680

Див. також

• Хромосома 5