TP53BP1

TP53BP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GZH, 1KZY, 1XNI, 2G3R, 2IG0, 2LVM, 2MWO, 2MWP, 3LGF, 3LGL, 3LH0, 4CRI, 4RG2, 4X34, 5ECG
Ідентифікатори
Символи	TP53BP1, 53BP1, p202, p53BP1, TP53, TDRD30, tumor protein p53 binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605230 MGI: 1351320 HomoloGene: 4137 GeneCards: TP53BP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin modification-dependent histone binding • damaged DNA binding • methylated histone binding • telomeric DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0031493 histone binding Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • хромосома • теломера • центромера • кінетохор • ядерні тільця • клітинне ядро • replication fork • site of double-strand break • DNA repair complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to X-ray • DNA damage checkpoint signaling • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0100026 Репарація ДНК • protein homooligomerization • double-strand break repair via nonhomologous end joining • positive regulation of isotype switching • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7158	27223
Ensembl	ENSG00000067369	ENSMUSG00000043909
UniProt	Q12888	P70399
RefSeq (мРНК)	NM_001141979 NM_001141980 NM_005657 NM_001355001	NM_001290830 NM_013735
RefSeq (білок)	NP_001135451 NP_001135452 NP_005648 NP_001341930	NP_001277759 NP_038763
Локус (UCSC)	Хр. 15: 43.4 – 43.51 Mb	Хр. 2: 121.02 – 121.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TP53BP1 (англ. Tumor protein p53 binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 972 амінокислот, а молекулярна маса — 213 574.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPTGSQLDS		DFSQQDTPCL		IIEDSQPESQ		VLEDDSGSHF		SMLSRHLPNL
QTHKENPVLD		VVSNPEQTAG		EERGDGNSGF		NEHLKENKVA		DPVDSSNLDT
CGSISQVIEQ		LPQPNRTSSV		LGMSVESAPA		VEEEKGEELE		QKEKEKEEDT
SGNTTHSLGA		EDTASSQLGF		GVLELSQSQD		VEENTVPYEV		DKEQLQSVTT
NSGYTRLSDV		DANTAIKHEE		QSNEDIPIAE		QSSKDIPVTA		QPSKDVHVVK
EQNPPPARSE		DMPFSPKASV		AAMEAKEQLS		AQELMESGLQ		IQKSPEPEVL
STQEDLFDQS		NKTVSSDGCS		TPSREEGGCS		LASTPATTLH		LLQLSGQRSL
VQDSLSTNSS		DLVAPSPDAF		RSTPFIVPSS		PTEQEGRQDK		PMDTSVLSEE
GGEPFQKKLQ		SGEPVELENP		PLLPESTVSP		QASTPISQST		PVFPPGSLPI
PSQPQFSHDI		FIPSPSLEEQ		SNDGKKDGDM		HSSSLTVECS		KTSEIEPKNS
PEDLGLSLTG		DSCKLMLSTS		EYSQSPKMES		LSSHRIDEDG		ENTQIEDTEP
MSPVLNSKFV		PAENDSILMN		PAQDGEVQLS		QNDDKTKGDD		TDTRDDISIL
ATGCKGREET		VAEDVCIDLT		CDSGSQAVPS		PATRSEALSS		VLDQEEAMEI
KEHHPEEGSS		GSEVEEIPET		PCESQGEELK		EENMESVPLH		LSLTETQSQG
LCLQKEMPKK		ECSEAMEVET		SVISIDSPQK		LAILDQELEH		KEQEAWEEAT
SEDSSVVIVD		VKEPSPRVDV		SCEPLEGVEK		CSDSQSWEDI		APEIEPCAEN
RLDTKEEKSV		EYEGDLKSGT		AETEPVEQDS		SQPSLPLVRA		DDPLRLDQEL
QQPQTQEKTS		NSLTEDSKMA		NAKQLSSDAE		AQKLGKPSAH		ASQSFCESSS
ETPFHFTLPK		EGDIIPPLTG		ATPPLIGHLK		LEPKRHSTPI		GISNYPESTI
ATSDVMSESM		VETHDPILGS		GKGDSGAAPD		VDDKLCLRMK		LVSPETEASE
ESLQFNLEKP		ATGERKNGST		AVAESVASPQ		KTMSVLSCIC		EARQENEARS
EDPPTTPIRG		NLLHFPSSQG		EEEKEKLEGD		HTIRQSQQPM		KPISPVKDPV
SPASQKMVIQ		GPSSPQGEAM		VTDVLEDQKE		GRSTNKENPS		KALIERPSQN
NIGIQTMECS		LRVPETVSAA		TQTIKNVCEQ		GTSTVDQNFG		KQDATVQTER
GSGEKPVSAP		GDDTESLHSQ		GEEEFDMPQP		PHGHVLHRHM		RTIREVRTLV
TRVITDVYYV		DGTEVERKVT		EETEEPIVEC		QECETEVSPS		QTGGSSGDLG
DISSFSSKAS		SLHRTSSGTS		LSAMHSSGSS		GKGAGPLRGK		TSGTEPADFA
LPSSRGGPGK		LSPRKGVSQT		GTPVCEEDGD		AGLGIRQGGK		APVTPRGRGR
RGRPPSRTTG		TRETAVPGPL		GIEDISPNLS		PDDKSFSRVV		PRVPDSTRRT
DVGAGALRRS		DSPEIPFQAA		AGPSDGLDAS		SPGNSFVGLR		VVAKWSSNGY
FYSGKITRDV		GAGKYKLLFD		DGYECDVLGK		DILLCDPIPL		DTEVTALSED
EYFSAGVVKG		HRKESGELYY		SIEKEGQRKW		YKRMAVILSL		EQGNRLREQY
GLGPYEAVTP		LTKAADISLD		NLVEGKRKRR		SNVSSPATPT		ASSSSSTTPT
RKITESPRAS		MGVLSGKRKL		ITSEEERSPA		KRGRKSATVK		PGAVGAGEFV
SPCESGDNTG		EPSALEEQRG		PLPLNKTLFL		GYAFLLTMAT		TSDKLASRSK
LPDGPTGSSE		EEEEFLEIPP		FNKQYTESQL		RAGAGYILED		FNEAQCNTAY
QCLLIADQHC		RTRKYFLCLA		SGIPCVSHVW		VHDSCHANQL		QNYRNYLLPA
GYSLEEQRIL		DWQPRENPFQ		NLKVLLVSDQ		QQNFLELWSE		ILMTGGAASV
KQHHSSAHNK		DIALGVFDVV		VTDPSCPASV		LKCAEALQLP		VVSQEWVIQC
LIVGERIGFK		QHPKYKHDYV		SH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Iwabuchi K., Bartel P.L., Li B., Marraccino R., Fields S. (1994). Two cellular proteins that bind to wild-type but not mutant p53. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6098—6102. PMID 8016121 DOI:10.1073/pnas.91.13.6098
• Xia Z., Morales J.C., Dunphy W.G., Carpenter P.B. (2001). Negative cell cycle regulation and DNA-damage inducible phosphorylation of the BRCT protein 53BP1. J. Biol. Chem. 276: 2708—2718. PMID 11042216 DOI:10.1074/jbc.M007665200
• Rappold I., Iwabuchi K., Date T., Chen J. (2001). Tumor suppressor p53 binding protein 1 (53BP1) is involved in DNA damage-signaling pathways. J. Cell Biol. 153: 613—620. PMID 11331310 DOI:10.1083/jcb.153.3.613
• Wang B., Matsuoka S., Carpenter P.B., Elledge S.J. (2002). 53BP1, a mediator of the DNA damage checkpoint. Science. 298: 1435—1438. PMID 12364621 DOI:10.1126/science.1076182
• Stewart G.S., Wang B., Bignell C.R., Taylor A.M.R., Elledge S.J. (2003). MDC1 is a mediator of the mammalian DNA damage checkpoint. Nature. 421: 961—966. PMID 12607005 DOI:10.1038/nature01446

Див. також

• Хромосома 15