TFEC

TFEC
Ідентифікатори
Символи	TFEC, TCFEC, TFE-C, TFEC-L, TFECL, bHLHe34, hTFEC-L, transcription factor EC
Зовнішні ІД	OMIM: 604732 MGI: 1333760 HomoloGene: 32148 GeneCards: TFEC
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein dimerization activity; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• cellular response to heat; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of nucleic acid-templated transcription; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	22797
	21426
	ENSG00000105967
	ENSMUSG00000029553
	O14948
	Q9WTW4
	NM_001018058; NM_001244583; NM_012252
	NM_031198
	NP_001018068; NP_001231512; NP_036384
	NP_112475
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TFEC (англ. Transcription factor EC) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 38 788^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTLDHQIINP	TLKWSQPAVP	SGGPLVQHAH	TTLDSDAGLT	ENPLTKLLAI
GKEDDNAQWH	MEDVIEDIIG	MESSFKEEGA	DSPLLMQRTL	SGSILDVYSG
EQGISPINMG	LTSASCPSSL	PMKREITETD	TRALAKERQK	KDNHNLIERR
RRYNINYRIK	ELGTLIPKSN	DPDMRWNKGT	ILKASVEYIK	WLQKEQQRAR
ELEHRQKKLE	QANRRLLLRI	QELEIQARTH	GLPTLASLGT	VDLGAHVTKQ
QSHPEQNSVD	YCQQLTVSQG	PSPELCDQAI	AFSDPLSYFT	DLSFSAALKE
EQRLDGMLLD	DTISPFGTDP	LLSATSPAVS	KESSRRSSFS	SDDGDEL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Yasumoto K., Shibahara S. (1997). Molecular cloning of cDNA encoding a human TFEC isoform, a newly identified transcriptional regulator. Biochim. Biophys. Acta. 1353: 23—31. PMID 9256061 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00034-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kuiper R.P., Schepens M., Thijssen J., Schoenmakers E.F.P.M., Geurts van Kessel A. (2004). Regulation of the MiTF/TFE bHLH-LZ transcription factors through restricted spatial expression and alternative splicing of functional domains. Nucleic Acids Res. 32: 2315—2322. PMID 15118077 DOI:10.1093/nar/gkh571
Chung M.-C., Kim H.-K., Kawamoto S. (2001). TFEC can function as a transcriptional activator of the nonmuscle myosin II heavy chain-A gene in transfected cells. Biochemistry. 40: 8887—8897. PMID 11467950 DOI:10.1021/bi002847d