SNRPB2

SNRPB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1A9N
Ідентифікатори
Символи	SNRPB2, Msl1, U2B, small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2
Зовнішні ІД	OMIM: 603520 MGI: 104805 HomoloGene: 37728 GeneCards: SNRPB2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • snRNA stem-loop binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • snRNP binding • U1 snRNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • U2 snRNP • small nuclear ribonucleoprotein complex • fibrillar center • нуклеоплазма • nuclear speck • U1 snRNP • U2-type catalytic step 2 spliceosome • клітинне ядро • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6629	20639
Ensembl	ENSG00000125870	ENSMUSG00000008333
UniProt	P08579	Q9CQI7
RefSeq (мРНК)	NM_198220 NM_003092	NM_021335
RefSeq (білок)	NP_003083 NP_937863	NP_067310
Локус (UCSC)	Хр. 20: 16.73 – 16.74 Mb	Хр. 2: 142.9 – 142.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNRPB2 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 225 амінокислот, а молекулярна маса — 25 486.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDIRPNHTIY		INNMNDKIKK		EELKRSLYAL		FSQFGHVVDI		VALKTMKMRG
QAFVIFKELG		SSTNALRQLQ		GFPFYGKPMR		IQYAKTDSDI		ISKMRGTFAD
KEKKKEKKKA		KTVEQTATTT		NKKPGQGTPN		SANTQGNSTP		NPQVPDYPPN
YILFLNNLPE		ETNEMMLSML		FNQFPGFKEV		RLVPGRHDIA		FVEFENDGQA
GAARDALQGF		KITPSHAMKI		TYAKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 doi:10.1017/S1355838202021088
• Price S.R., Evans P.R., Nagai K. (1998). Crystal structure of the spliceosomal U2B'-U2A' protein complex bound to a fragment of U2 small nuclear RNA. Nature. 394: 645—650. PMID 9716128 doi:10.1038/29234

Див. також

• Хромосома 20