RPL17

RPL17
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4V5Z, 4UJD, 5A8L, 4D67, 3J92, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPL17, L17, PD-1, RPL23, ribosomal protein L17
Зовнішні ІД	OMIM: 603661 HomoloGene: 115574 GeneCards: RPL17
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural constituent of ribosome • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • рибосома • large ribosomal subunit • внутрішньоклітинний • cytosolic large ribosomal subunit • клітинне ядро Біологічний процес • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • rRNA processing • Біосинтез білків • cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6139	853262
Ensembl	ENSG00000265681	YJL177W
UniProt	P18621	P46990
RefSeq (мРНК)	NM_001199345 NM_000985 NM_001035006 NM_001199340 NM_001199341 NM_001199342 NM_001199343 NM_001199344	NM_001181610
RefSeq (білок)	NP_000976 NP_001030178 NP_001186269 NP_001186270 NP_001186271 NP_001186272 NP_001186273 NP_001186274 NP_001356484 NP_001356485 NP_001356486 NP_001356487 NP_001356489 NP_001356490 NP_001356491 NP_001356492	NP_012358
Локус (UCSC)	Хр. 18: 49.49 – 49.49 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPL17 (англ. Ribosomal protein L17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 184 амінокислот, а молекулярна маса — 21 397.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRYSLDPEN		PTKSCKSRGS		NLRVHFKNTR		ETAQAIKGMH		IRKATKYLKD
VTLQKQCVPF		RRYNGGVGRC		AQAKQWGWTQ		GRWPKKSAEF		LLHMLKNAES
NAELKGLDVD		SLVIEHIQVN		KAPKMRRRTY		RAHGRINPYM		SSPCHIEMIL
TEKEQIVPKP		EEEVAQKKKI		SQKKLKKQKL		MARE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Mager D.L., Freeman J.D. (1990). A human gene related to the ribosomal protein L23 gene of Halobacterium marismortui. Nucleic Acids Res. 18: 5301—5301. PMID 2402465 DOI:10.1093/nar/18.17.5301
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Batra S.K., Metzgar R.S., Hollingsworth M.A. (1991). Isolation and characterization of a complementary DNA (PD-1) differentially expressed by human pancreatic ductal cell tumors. Cell Growth Differ. 2: 385—390. PMID 1793733

Див. також

• Хромосома 18