RNGTT

RNGTT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2C46, 3S24
Ідентифікатори
Символи	RNGTT, CAP1A, HCE, HCE1, hCAP, RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase
Зовнішні ІД	OMIM: 603512 MGI: 1329041 HomoloGene: 37851 GeneCards: RNGTT
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • polynucleotide 5'-phosphatase activity • RNA guanylyltransferase activity • triphosphatase activity • nucleotidyltransferase activity • mRNA guanylyltransferase activity • каталітична активність • hydrolase activity • nucleotide binding • GTP binding • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0016576 protein dephosphorylation • transcription by RNA polymerase II • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • 7-methylguanosine mRNA capping • обмін речовин • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • polynucleotide 5' dephosphorylation • GO:0022415 viral process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8732	24018
Ensembl	ENSG00000111880	ENSMUSG00000028274
UniProt	O60942	O55236
RefSeq (мРНК)	NM_001286426 NM_001286428 NM_003800	NM_011884 NM_001305273
RefSeq (білок)	NP_001273355 NP_001273357 NP_003791	NP_001292202 NP_036014
Локус (UCSC)	Хр. 6: 88.61 – 88.96 Mb	Хр. 4: 33.31 – 33.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNGTT (англ. RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 597 амінокислот, а молекулярна маса — 68 557.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHNKIPPRW		LNCPRRGQPV		AGRFLPLKTM		LGPRYDSQVA		EENRFHPSML
SNYLKSLKVK		MGLLVDLTNT		SRFYDRNDIE		KEGIKYIKLQ		CKGHGECPTT
ENTETFIRLC		ERFNERNPPE		LIGVHCTHGF		NRTGFLICAF		LVEKMDWSIE
AAVATFAQAR		PPGIYKGDYL		KELFRRYGDI		EEAPPPPLLP		DWCFEDDEDE
DEDEDGKKES		EPGSSASFGK		RRKERLKLGA		IFLEGVTVKG		VTQVTTQPKL
GEVQQKCHQF		CGWEGSGFPG		AQPVSMDKQN		IKLLDLKPYK		VSWKADGTRY
MMLIDGTNEV		FMIDRDNSVF		HVSNLEFPFR		KDLRMHLSNT		LLDGEMIIDR
VNGQAVPRYL		IYDIIKFNSQ		PVGDCDFNVR		LQCIEREIIS		PRHEKMKTGL
IDKTQEPFSV		RNKPFFDICT		SRKLLEGNFA		KEVSHEMDGL		IFQPTGKYKP
GRCDDILKWK		PPSLNSVDFR		LKITRMGGEG		LLPQNVGLLY		VGGYERPFAQ
IKVTKELKQY		DNKIIECKFE		NNSWVFMRQR		TDKSFPNAYN		TAMAVCNSIS
NPVTKEMLFE		FIDRCTAASQ		GQKRKHHLDP		DTELMPPPPP		KRPRPLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

• Yamada-Okabe T., Doi R., Shimmi O., Arisawa M., Yamada-Okabe H. (1998). Isolation and characterization of a human cDNA for mRNA 5'-capping enzyme. Nucleic Acids Res. 26: 1700—1706. PMID 9512541 DOI:10.1093/nar/26.7.1700
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pillutla R.C., Yue Z., Maldonado E., Shatkin A.J. (1998). Recombinant human mRNA cap methyltransferase binds capping enzyme/RNA polymerase IIo complexes. J. Biol. Chem. 273: 21443—21446. PMID 9705270 DOI:10.1074/jbc.273.34.21443
• Wen Y., Shatkin A.J. (1999). Transcription elongation factor hSPT5 stimulates mRNA capping. Genes Dev. 13: 1774—1779. PMID 10421630 DOI:10.1101/gad.13.14.1774
• Chiu Y.-L., Coronel E., Ho C.K., Shuman S., Rana T.M. (2001). HIV-1 Tat protein interacts with mammalian capping enzyme and stimulates capping of TAR RNA. J. Biol. Chem. 276: 12959—12966. PMID 11278368 DOI:10.1074/jbc.M007901200

Див. також

• Хромосома 6