RHOD

RHOD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2J1L
Ідентифікатори
Символи	RHOD, ARHD, RHOHP1, RHOM, Rho, RhoD, ras homolog family member D
Зовнішні ІД	OMIM: 605781 MGI: 108446 HomoloGene: 22409 GeneCards: RHOD
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein kinase binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • early endosome • endosome membrane • ендосома • мембрана • гіалоплазма • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • цитоплазма • cell cortex • cell division site • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • positive regulation of cell adhesion • focal adhesion assembly • actin filament bundle assembly • regulation of actin cytoskeleton reorganization • positive regulation of cell migration • lamellipodium assembly • Rho protein signal transduction • regulation of focal adhesion assembly • сортування білків • regulation of small GTPase mediated signal transduction • small GTPase mediated signal transduction • actin filament organization • regulation of cell shape • cell migration • regulation of cell migration • establishment or maintenance of actin cytoskeleton polarity • regulation of actin cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29984	11854
Ensembl	ENSG00000173156	ENSMUSG00000041845
UniProt	O00212	P97348
RefSeq (мРНК)	NM_014578 NM_001300886	NM_007485 NM_001329989
RefSeq (білок)	NP_001287815 NP_055393	NP_001316918 NP_031511
Локус (UCSC)	Хр. 11: 67.06 – 67.07 Mb	Хр. 19: 4.48 – 4.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RHOD (англ. Ras homolog family member D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 210 амінокислот, а молекулярна маса — 23 413.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTAAQAAGEE		APPGVRSVKV		VLVGDGGCGK		TSLLMVFADG		AFPESYTPTV
FERYMVNLQV		KGKPVHLHIW		DTAGQDDYDR		LRPLFYPDAS		VLLLCFDVTS
PNSFDNIFNR		WYPEVNHFCK		KVPIIVVGCK		TDLCKDKSLV		NKLRRNGLEP
VTYHRGQEMA		RSVGAVAYLE		CSARLHDNVH		AVFQEAAEVA		LSSRGRNFWR
RITQGFCVVT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gasman S., Kalaidzidis Y., Zerial M. (2003). RhoD regulates endosome dynamics through diaphanous-related formin and Src tyrosine kinase. Nat. Cell Biol. 5: 195—204. PMID 12577064 DOI:10.1038/ncb935
• Wu X., Frost J.A. (2006). Multiple Rho proteins regulate the subcellular targeting of PAK5. Biochem. Biophys. Res. Commun. 351: 328—335. PMID 17064668 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.172
• Gad A.K., Nehru V., Ruusala A., Aspenstrom P. (2012). RhoD regulates cytoskeletal dynamics via the actin nucleation-promoting factor WASp homologue associated with actin Golgi membranes and microtubules. Mol. Biol. Cell. 23: 4807—4819. PMID 23087206 DOI:10.1091/mbc.E12-07-0555
• Nehru V., Almeida F.N., Aspenstrom P. (2013). Interaction of RhoD and ZIP kinase modulates actin filament assembly and focal adhesion dynamics. Biochem. Biophys. Res. Commun. 433: 163—169. PMID 23454120 DOI:10.1016/j.bbrc.2013.02.046
• Nehru V., Voytyuk O., Lennartsson J., Aspenstroem P. (2013). RhoD binds the Rab5 effector Rabankyrin-5 and has a role in trafficking of the platelet-derived growth factor receptor. Traffic. 14: 1242—1254. PMID 24102721 DOI:10.1111/tra.12121

Див. також

• Хромосома 11