RBFOX1

RBFOX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ERR, 4ZKA, 2N82
Ідентифікатори
Символи	RBFOX1, 2BP1, A2BP1, FOX-1, FOX1, HRNBP1, RNA binding protein, fox-1 homolog 1, RNA binding fox-1 homolog 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605104 MGI: 1926224 HomoloGene: 69339 GeneCards: RBFOX1
Пов'язані генетичні захворювання
аметропія, ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • trans-Golgi network • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of RNA splicing • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • нейробіологія розвитку • RNA transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54715	268859
Ensembl	ENSG00000078328	ENSMUSG00000008658
UniProt	Q9NWB1	Q9JJ43
RefSeq (мРНК)	NM_001142333 NM_001142334 NM_001308117 NM_018723 NM_145891 NM_145892 NM_145893 NM_001364800	NM_021477 NM_183188 NM_001359723 NM_001359724 NM_001359725 NM_001359726 NM_001359728 NM_001359729 NM_001359730
RefSeq (білок)	NP_001135805 NP_001135806 NP_001295046 NP_061193 NP_665898 NP_665899 NP_665900 NP_001351729	NP_067452 NP_899011 NP_001346652 NP_001346653 NP_001346654 NP_001346655 NP_001346657 NP_001346658 NP_001346659
Локус (UCSC)	Хр. 16: 5.24 – 7.71 Mb	Хр. 16: 5.89 – 7.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBFOX1 (англ. RNA binding protein, fox-1 homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 42 784.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNCEREQLRG		NQEAAAAPDT		MAQPYASAQF		APPQNGIPAE		YTAPHPHPAP
EYTGQTTVPE		HTLNLYPPAQ		THSEQSPADT		SAQTVSGTAT		QTDDAAPTDG
QPQTQPSENT		ENKSQPKRLH		VSNIPFRFRD		PDLRQMFGQF		GKILDVEIIF
NERGSKGFGF		VTFENSADAD		RAREKLHGTV		VEGRKIEVNN		ATARVMTNKK
TVNPYTNGWK		LNPVVGAVYS		PEFYAGTVLL		CQANQEGSSM		YSAPSSLVYT
SAMPGFPYPA		ATAAAAYRGA		HLRGRGRTVY		NTFRAAAPPP		PIPAYGGVVY
QDGFYGADIY		GGYAAYRYAQ		PTPATAAAYS		DSYGRVYAAD		PYHHALAPAP
TYGVGAMNAF		APLTDAKTRS		HADDVGLVLS		SLQASIYRGG		YNRFAPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Shibata H., Huynh D.P., Pulst S.-M. (2000). A novel protein with RNA-binding motifs interacts with ataxin-2. Hum. Mol. Genet. 9: 1303—1313. PMID 10814712 DOI:10.1093/hmg/9.9.1303
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16