PTPN22

PTPN22
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2P6X, 2QCJ, 2QCT, 3BRH, 3H2X, 3OLR, 3OMH, 4J51
Ідентифікатори
Символи	PTPN22, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22 (lymphoid), LYP, LYP1, LYP2, PEP, PTPN8, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, PTPN22.6, PTPN22.5, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 22
Зовнішні ІД	OMIM: 600716 MGI: 107170 HomoloGene: 7498 GeneCards: PTPN22
Пов'язані генетичні захворювання
	цукровий діабет 1-го типу, вітиліго
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity; • SH3 domain binding; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • kinase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • ubiquitin protein ligase binding; • protein tyrosine phosphatase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • perinuclear region of cytoplasm; • cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of protein K63-linked ubiquitination; • regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • regulation of innate immune response; • regulation of natural killer cell proliferation; • positive regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway; • regulation of T cell receptor signaling pathway; • regulation of B cell receptor signaling pathway; • phosphoanandamide dephosphorylation; • процес імунної системи; • negative regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway; • negative regulation of p38MAPK cascade; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • negative regulation of gene expression; • negative regulation of T cell receptor signaling pathway; • cellular response to muramyl dipeptide; • автофагія; • response to lipopolysaccharide; • T cell differentiation; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • negative regulation of autophagy; • negative regulation of JUN kinase activity; • negative regulation of T cell activation; • positive regulation of type I interferon production; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • T cell receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	26191
	19260
	ENSG00000134242
	ENSMUSG00000027843
	Q9Y2R2
	P29352
	NM_001193431; NM_001308297; NM_012411; NM_015967
	NM_008979
	NP_001180360; NP_001295226; NP_036543; NP_057051
	NP_033005
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPN22 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 807 амінокислот, а молекулярна маса — 91 705^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDQREILQKF	LDEAQSKKIT	KEEFANEFLK	LKRQSTKYKA	DKTYPTTVAE
KPKNIKKNRY	KDILPYDYSR	VELSLITSDE	DSSYINANFI	KGVYGPKAYI
ATQGPLSTTL	LDFWRMIWEY	SVLIIVMACM	EYEMGKKKCE	RYWAEPGEMQ
LEFGPFSVSC	EAEKRKSDYI	IRTLKVKFNS	ETRTIYQFHY	KNWPDHDVPS
SIDPILELIW	DVRCYQEDDS	VPICIHCSAG	CGRTGVICAI	DYTWMLLKDG
IIPENFSVFS	LIREMRTQRP	SLVQTQEQYE	LVYNAVLELF	KRQMDVIRDK
HSGTESQAKH	CIPEKNHTLQ	ADSYSPNLPK	STTKAAKMMN	QQRTKMEIKE
SSSFDFRTSE	ISAKEELVLH	PAKSSTSFDF	LELNYSFDKN	ADTTMKWQTK
AFPIVGEPLQ	KHQSLDLGSL	LFEGCSNSKP	VNAAGRYFNS	KVPITRTKST
PFELIQQRET	KEVDSKENFS	YLESQPHDSC	FVEMQAQKVM	HVSSAELNYS
LPYDSKHQIR	NASNVKHHDS	SALGVYSYIP	LVENPYFSSW	PPSGTSSKMS
LDLPEKQDGT	VFPSSLLPTS	STSLFSYYNS	HDSLSLNSPT	NISSLLNQES
AVLATAPRID	DEIPPPLPVR	TPESFIVVEE	AGEFSPNVPK	SLSSAVKVKI
GTSLEWGGTS	EPKKFDDSVI	LRPSKSVKLR	SPKSELHQDR	SSPPPPLPER
TLESFFLADE	DCMQAQSIET	YSTSYPDTME	NSTSSKQTLK	TPGKSFTRSK
SLKILRNMKK	SICNSCPPNK	PAESVQSNNS	SSFLNFGFAN	RFSKPKGPRN
PPPTWNI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, автофагія. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vang T., Miletic A.V., Bottini N., Mustelin T. (2007). Protein tyrosine phosphatase PTPN22 in human autoimmunity. Autoimmunity. 40: 453—461. PMID 17729039 DOI:10.1080/08916930701464897
Cohen S., Dadi H., Shaoul E., Sharfe N., Roifman C.M. (1999). Cloning and characterization of a lymphoid-specific, inducible human protein tyrosine phosphatase, Lyp. Blood. 93: 2013—2024. PMID 10068674

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPN22 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9652 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 23 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2R2 (англ.) . Архів оригіналу за 30 січня 2017. Процитовано 23 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PTPN22 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9652 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 23 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9Y2R2 (англ.) . Архів оригіналу за 30 січня 2017. Процитовано 23 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

PTPN22

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук