MSLN

MSLN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4F3F
Ідентифікатори
Символи	MSLN, MPF, SMRP, mesothelin
Зовнішні ІД	OMIM: 601051 MGI: 1888992 HomoloGene: 4249 GeneCards: MSLN
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • cell surface • anchored component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • extracellular region • міжклітинний простір • клітинна мембрана • endoplasmic reticulum lumen Біологічний процес • pancreas development • адгезія клітин • cell-matrix adhesion • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10232	56047
Ensembl	ENSG00000102854	ENSMUSG00000063011
UniProt	Q13421	Q61468
RefSeq (мРНК)	NM_001177355 NM_005823 NM_013404	NM_018857 NM_001356286 NM_001374653
RefSeq (білок)	NP_001170826 NP_005814 NP_037536	NP_061345 NP_001343215
Локус (UCSC)	Хр. 16: 0.76 – 0.77 Mb	Хр. 17: 25.97 – 25.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MSLN (англ. Mesothelin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 630 амінокислот, а молекулярна маса — 68 986.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALPTARPLL		GSCGTPALGS		LLFLLFSLGW		VQPSRTLAGE		TGQEAAPLDG
VLANPPNISS		LSPRQLLGFP		CAEVSGLSTE		RVRELAVALA		QKNVKLSTEQ
LRCLAHRLSE		PPEDLDALPL		DLLLFLNPDA		FSGPQACTRF		FSRITKANVD
LLPRGAPERQ		RLLPAALACW		GVRGSLLSEA		DVRALGGLAC		DLPGRFVAES
AEVLLPRLVS		CPGPLDQDQQ		EAARAALQGG		GPPYGPPSTW		SVSTMDALRG
LLPVLGQPII		RSIPQGIVAA		WRQRSSRDPS		WRQPERTILR		PRFRREVEKT
ACPSGKKARE		IDESLIFYKK		WELEACVDAA		LLATQMDRVN		AIPFTYEQLD
VLKHKLDELY		PQGYPESVIQ		HLGYLFLKMS		PEDIRKWNVT		SLETLKALLE
VNKGHEMSPQ		APRRPLPQVA		TLIDRFVKGR		GQLDKDTLDT		LTAFYPGYLC
SLSPEELSSV		PPSSIWAVRP		QDLDTCDPRQ		LDVLYPKARL		AFQNMNGSEY
FVKIQSFLGG		APTEDLKALS		QQNVSMDLAT		FMKLRTDAVL		PLTVAEVQKL
LGPHVEGLKA		EERHRPVRDW		ILRQRQDDLD		TLGLGLQGGI		PNGYLVLDLS
MQEALSGTPC		LLGPGPVLTV		LALLLASTLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.

Література

• Chang K., Pastan I. (1996). Molecular cloning of mesothelin, a differentiation antigen present on mesothelium, mesotheliomas, and ovarian cancers. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 136—140. PMID 8552591 DOI:10.1073/pnas.93.1.136
• Muminova Z.E., Strong T.V., Shaw D.R. (2004). Characterization of human mesothelin transcripts in ovarian and pancreatic cancer. BMC Cancer. 4: 19—19. PMID 15140265 DOI:10.1186/1471-2407-4-19
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ma J., Tang W.K., Esser L., Pastan I., Xia D. (2012). Recognition of mesothelin by the therapeutic antibody MORAb-009: structural and mechanistic insights. J. Biol. Chem. 287: 33123—33131. PMID 22787150 DOI:10.1074/jbc.M112.381756

Див. також

• Хромосома 16