ITGAM

ITGAM
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BHO, 1BHQ, 1IDN, 1IDO, 1JLM, 1M1U, 1MF7, 1N9Z, 1NA5, 2LKE, 2LKJ, 3Q3G, 3QA3, 4M76, 4XW2
Ідентифікатори
Символи	ITGAM, CD11B, CR3A, MAC-1, MAC1A, MO1A, SLEB6, integrin subunit alpha M
Зовнішні ІД	OMIM: 120980 MGI: 96607 HomoloGene: 526 GeneCards: ITGAM
Пов'язані генетичні захворювання
	системний червоний вовчак
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • heat shock protein binding; • amyloid-beta binding; • complement component C3b binding; • cargo receptor activity;
Клітинна компонента	• екзосома; • клітинна мембрана; • cell surface; • мембрана; • integral component of membrane; • integrin complex; • міжклітинний простір; • specific granule membrane; • tertiary granule membrane; • external side of plasma membrane; • integrin alphaM-beta2 complex; • plasma membrane raft; • membrane raft;
Біологічний процес	• ectodermal cell differentiation; • toll-like receptor 4 signaling pathway; • integrin-mediated signaling pathway; • leukocyte migration; • extracellular matrix organization; • адгезія клітин; • neutrophil degranulation; • microglial cell activation; • процес імунної системи; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • phagocytosis, engulfment; • cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of superoxide anion generation; • positive regulation of neutrophil degranulation; • вроджений імунітет; • negative regulation of dopamine metabolic process; • positive regulation of protein targeting to membrane; • amyloid-beta clearance; • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules; • complement-mediated synapse pruning; • vertebrate eye-specific patterning; • positive regulation of neuron death; • positive regulation of microglial cell activation; • positive regulation of microglial cell mediated cytotoxicity; • cell surface receptor signaling pathway involved in cell-cell signaling; • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity; • forebrain development; • apoptotic signaling pathway; • positive regulation of hippocampal neuron apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3684
	16409
	ENSG00000169896
	ENSMUSG00000030786
	P11215
	P05555
	NM_000632; NM_001145808
	NM_001082960; NM_008401
	NP_000623; NP_001139280
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGAM (англ. Integrin subunit alpha M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 152 амінокислот, а молекулярна маса — 127 179^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALRVLLLTA	LTLCHGFNLD	TENAMTFQEN	ARGFGQSVVQ	LQGSRVVVGA
PQEIVAANQR	GSLYQCDYST	GSCEPIRLQV	PVEAVNMSLG	LSLAATTSPP
QLLACGPTVH	QTCSENTYVK	GLCFLFGSNL	RQQPQKFPEA	LRGCPQEDSD
IAFLIDGSGS	IIPHDFRRMK	EFVSTVMEQL	KKSKTLFSLM	QYSEEFRIHF
TFKEFQNNPN	PRSLVKPITQ	LLGRTHTATG	IRKVVRELFN	ITNGARKNAF
KILVVITDGE	KFGDPLGYED	VIPEADREGV	IRYVIGVGDA	FRSEKSRQEL
NTIASKPPRD	HVFQVNNFEA	LKTIQNQLRE	KIFAIEGTQT	GSSSSFEHEM
SQEGFSAAIT	SNGPLLSTVG	SYDWAGGVFL	YTSKEKSTFI	NMTRVDSDMN
DAYLGYAAAI	ILRNRVQSLV	LGAPRYQHIG	LVAMFRQNTG	MWESNANVKG
TQIGAYFGAS	LCSVDVDSNG	STDLVLIGAP	HYYEQTRGGQ	VSVCPLPRGR
ARWQCDAVLY	GEQGQPWGRF	GAALTVLGDV	NGDKLTDVAI	GAPGEEDNRG
AVYLFHGTSG	SGISPSHSQR	IAGSKLSPRL	QYFGQSLSGG	QDLTMDGLVD
LTVGAQGHVL	LLRSQPVLRV	KAIMEFNPRE	VARNVFECND	QVVKGKEAGE
VRVCLHVQKS	TRDRLREGQI	QSVVTYDLAL	DSGRPHSRAV	FNETKNSTRR
QTQVLGLTQT	CETLKLQLPN	CIEDPVSPIV	LRLNFSLVGT	PLSAFGNLRP
VLAEDAQRLF	TALFPFEKNC	GNDNICQDDL	SITFSFMSLD	CLVVGGPREF
NVTVTVRNDG	EDSYRTQVTF	FFPLDLSYRK	VSTLQNQRSQ	RSWRLACESA
SSTEVSGALK	STSCSINHPI	FPENSEVTFN	ITFDVDSKAS	LGNKLLLKAN
VTSENNMPRT	NKTEFQLELP	VKYAVYMVVT	SHGVSTKYLN	FTASENTSRV
MQHQYQVSNL	GQRSLPISLV	FLVPVRLNQT	VIWDRPQVTF	SENLSSTCHT
KERLPSHSDF	LAELRKAPVV	NCSIAVCQRI	QCDIPFFGIQ	EEFNATLKGN
LSFDWYIKTS	HNHLLIVSTA	EILFNDSVFT	LLPGQGAFVR	SQTETKVEPF
EVPNPLPLIV	GSSVGGLLLL	ALITAALYKL	GFFKRQYKDM	MSEGGPPGAE
PQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

Arnaout M.A., Remold-O'Donnell E., Pierce M.W., Harris P., Tenen D.G. (1988). Molecular cloning of the alpha subunit of human and guinea pig leukocyte adhesion glycoprotein Mo1: chromosomal localization and homology to the alpha subunits of integrins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 2776—2780. PMID 2833753 DOI:10.1073/pnas.85.8.2776
Arnaout M.A., Gupta S.K., Pierce M.W., Tenen D.G. (1988). Amino acid sequence of the alpha subunit of human leukocyte adhesion receptor Mo1 (complement receptor type 3). J. Cell Biol. 106: 2153—2158. PMID 2454931 DOI:10.1083/jcb.106.6.2153
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shelley C.S., Arnaout M.A. (1991). The promoter of the CD11b gene directs myeloid-specific and developmentally regulated expression. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10525—10529. PMID 1683702 DOI:10.1073/pnas.88.23.10525
Pierce M.W., Remold-O'Donnell E., Todd R.F. III, Arnaout M.A. (1986). N-terminal sequence of human leukocyte glycoprotein Mo1: conservation across species and homology to platelet IIb/IIIa. Biochim. Biophys. Acta. 874: 368—371. PMID 3539202 DOI:10.1016/0167-4838(86)90037-3
Lee J.O., Rieu P., Arnaout M.A., Liddington R. (1995). Crystal structure of the A domain from the alpha subunit of integrin CR3 (CD11b/CD18). Cell. 80: 631—638. PMID 7867070 DOI:10.1016/0092-8674(95)90517-0

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGAM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6149 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P11215 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ITGAM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6149 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P11215 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350