IL16

IL16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1I16, 1X6D, 5FB8
Ідентифікатори
Символи	IL16, LCF, NPRprIL-16, IL-16, interleukin 16
Зовнішні ІД	OMIM: 603035 MGI: 1270855 HomoloGene: 18157 GeneCards: IL16
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • CD4 receptor binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • extracellular region • міжклітинний простір • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • induction of positive chemotaxis • хемотаксис • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • leukocyte chemotaxis • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • transcription, DNA-templated • regulation of calcium ion transport • regulation of signaling receptor activity • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3603	16170
Ensembl	ENSG00000172349	ENSMUSG00000001741
UniProt	Q14005	O54824
RefSeq (мРНК)	NM_001172128 NM_004513 NM_172217 NM_001352684 NM_001352685 NM_001352686	NM_010551 NM_001360087 NM_001360088 NM_001360089
RefSeq (білок)	NP_001165599 NP_004504 NP_757366 NP_001339613 NP_001339614 NP_001339615	NP_034681 NP_001347016 NP_001347017 NP_001347018
Локус (UCSC)	Хр. 15: 81.16 – 81.31 Mb	Хр. 7: 83.29 – 83.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IL16 (англ. Interleukin 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 332 амінокислот, а молекулярна маса — 141 752.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESHSRAGKS		RKSAKFRSIS		RSLMLCNAKT		SDDGSSPDEK		YPDPFEISLA
QGKEGIFHSS		VQLADTSEAG		PSSVPDLALA		SEAAQLQAAG		NDRGKTCRRI
FFMKESSTAS		SREKPGKLEA		QSSNFLFPKA		CHQRARSNST		SVNPYCTREI
DFPMTKKSAA		PTDRQPYSLC		SNRKSLSQQL		DCPAGKAAGT		SRPTRSLSTA
QLVQPSGGLQ		ASVISNIVLM		KGQAKGLGFS		IVGGKDSIYG		PIGIYVKTIF
AGGAAAADGR		LQEGDEILEL		NGESMAGLTH		QDALQKFKQA		KKGLLTLTVR
TRLTAPPSLC		SHLSPPLCRS		LSSSTCITKD		SSSFALESPS		APISTAKPNY
RIMVEVSLQK		EAGVGLGIGL		CSVPYFQCIS		GIFVHTLSPG		SVAHLDGRLR
CGDEIVEISD		SPVHCLTLNE		VYTILSHCDP		GPVPIIVSRH		PDPQVSEQQL
KEAVAQAVEN		TKFGKERHQW		SLEGVKRLES		SWHGRPTLEK		EREKNSAPPH
RRAQKVMIRS		SSDSSYMSGS		PGGSPGSGSA		EKPSSDVDIS		THSPSLPLAR
EPVVLSIASS		RLPQESPPLP		ESRDSHPPLR		LKKSFEILVR		KPMSSKPKPP
PRKYFKSDSD		PQKSLEEREN		SSCSSGHTPP		TCGQEARELL		PLLLPQEDTA
GRSPSASAGC		PGPGIGPQTK		SSTEGEPGWR		RASPVTQTSP		IKHPLLKRQA
RMDYSFDTTA		EDPWVRISDC		IKNLFSPIMS		ENHGHMPLQP		NASLNEEEGT
QGHPDGTPPK		LDTANGTPKV		YKSADSSTVK		KGPPVAPKPA		WFRQSLKGLR
NRASDPRGLP		DPALSTQPAP		ASREHLGSHI		RASSSSSSIR		QRISSFETFG
SSQLPDKGAQ		RLSLQPSSGE		AAKPLGKHEE		GRFSGLLGRG		AAPTLVPQQP
EQVLSSGSPA		ASEARDPGVS		ESPPPGRQPN		QKTLPPGPDP		LLRLLSTQAE
ESQGPVLKMP		SQRARSFPLT		RSQSCETKLL		DEKTSKLYSI		SSQVSSAVMK
SLLCLPSSIS		CAQTPCIPKE		GASPTSSSNE		DSAANGSAET		SALDTGFSLN
LSELREYTEG		LTEAKEDDDG		DHSSLQSGQS		VISLLSSEEL		KKLIEEVKVL
DEATLKQLDG		IHVTILHKEE		GAGLGFSLAG		GADLENKVIT		VHRVFPNGLA
SQEGTIQKGN		EVLSINGKSL		KGTTHHDALA		ILRQAREPRQ		AVIVTRKLTP
EAMPDLNSST		DSAASASAAS		DVSVESTAEA		TVCTVTLEKM		SAGLGFSLEG
GKGSLHGDKP		LTINRIFKGA		ASEQSETVQP		GDEILQLGGT		AMQGLTRFEA
WNIIKALPDG		PVTIVIRRKS		LQSKETTAAG		DS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, хемотаксис, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.

Література

• Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 DOI:10.1186/1471-2164-10-518
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bannert N., Avots A., Baier M., Serfling E., Kurth R. (1999). GA-binding protein factors, in concert with the coactivator CREB binding protein/p300, control the induction of the interleukin 16 promoter in T lymphocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 1541—1546. PMID 9990060 DOI:10.1073/pnas.96.4.1541
• Bannert N., Baier M., Werner A., Kurth R. (1996). Interleukin-16 or not?. Nature. 381: 30—30. PMID 8609984 DOI:10.1038/381030a0
• Feske S., Giltnane J., Dolmetsch R., Staudt L.M., Rao A. (2001). Gene regulation mediated by calcium signals in T lymphocytes. Nat. Immunol. 2: 316—324. PMID 11276202 DOI:10.1038/86318
• Wilson K.C., Cruikshank W.W., Center D.M., Zhang Y. (2002). Prointerleukin-16 contains a functional CcN motif that regulates nuclear localization. Biochemistry. 41: 14306—14312. PMID 12450396 DOI:10.1021/bi020163v

Див. також

• Хромосома 15