EFNA5

EFNA5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2X11, 3MX0, 4BK5, 4BKA, 4L0P, 4M4R
Ідентифікатори
Символи	EFNA5, AF1, EFL5, EPLG7, GLC1M, LERK7, RAGS, ephrin A5
Зовнішні ІД	OMIM: 601535 MGI: 107444 HomoloGene: 1482 GeneCards: EFNA5
Онтологія гена Молекулярна функція • neurotrophin TRKC receptor binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activator activity • neurotrophin TRKA receptor binding • ephrin receptor binding • chemorepellent activity • neurotrophin TRKB receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • мембрана • клітинна мембрана • anchored component of external side of plasma membrane • caveola • anchored component of membrane • базальна мембрана • Адгезивні контакти • периферія клітини • GABA-ergic synapse Біологічний процес • positive regulation of synapse assembly • GO:0097285 апоптоз • диференціація клітин • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • positive regulation of protein phosphorylation • negative chemotaxis • regulation of actin cytoskeleton organization • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • ephrin receptor signaling pathway • regulation of microtubule cytoskeleton organization • positive regulation of collateral sprouting • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • regulation of cell-cell adhesion • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • regulation of focal adhesion assembly • regulation of cell morphogenesis • collateral sprouting • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • retinal ganglion cell axon guidance • cellular response to follicle-stimulating hormone stimulus • cellular response to forskolin • activation of transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • axon guidance • synaptic membrane adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1946	13640
Ensembl	ENSG00000184349	ENSMUSG00000048915
UniProt	P52803	O08543
RefSeq (мРНК)	NM_001962	NM_010109 NM_207654
RefSeq (білок)	NP_001953	NP_034239 NP_997537
Локус (UCSC)	Хр. 5: 107.38 – 107.67 Mb	Хр. 17: 62.91 – 63.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EFNA5 (англ. Ephrin A5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 26 297.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLHVEMLTLV		FLVLWMCVFS		QDPGSKAVAD		RYAVYWNSSN		PRFQRGDYHI
DVCINDYLDV		FCPHYEDSVP		EDKTERYVLY		MVNFDGYSAC		DHTSKGFKRW
ECNRPHSPNG		PLKFSEKFQL		FTPFSLGFEF		RPGREYFYIS		SAIPDNGRRS
CLKLKVFVRP		TNSCMKTIGV		HDRVFDVNDK		VENSLEPADD		TVHESAEPSR
GENAAQTPRI		PSRLLAILLF		LLAMLLTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Kozlosky C.J., Vanden Bos T., Park L.S., Cerretti D.P., Carpenter M.K. (1997). LERK-7: a ligand of the Eph-related kinases is developmentally regulated in the brain. Cytokine. 9: 540—549. PMID 9245480 doi:10.1006/cyto.1997.0199
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Nikolov D.B., Li C., Lackmann M., Jeffrey P., Himanen J.P. (2007). Crystal structure of the human ephrin-A5 ectodomain. Protein Sci. 16: 996—1000. PMID 17400922 doi:10.1110/ps.062665807

Див. також

• Хромосома 5