COL9A3

COL9A3
Ідентифікатори
Символи	COL9A3, DJ885L7.4.1, EDM3, IDD, MED, collagen type IX alpha 3, collagen type IX alpha 3 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120270 MGI: 894686 HomoloGene: 20438 GeneCards: COL9A3
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • collagen type IX trimer • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • male gonad development • extracellular matrix organization • female gonad development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1299	12841
Ensembl	ENSG00000092758	ENSMUSG00000027570
UniProt	Q14050	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001853	NM_009936 NM_001378777
RefSeq (білок)	NP_001844	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 20: 62.82 – 62.84 Mb	Хр. 2: 180.24 – 180.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL9A3 (англ. Collagen type IX alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 684 амінокислот, а молекулярна маса — 63 616.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGPRACAPL		LLLLLLGELL		AAAGAQRVGL		PGPPGPPGPP		GKPGQDGIDG
EAGPPGLPGP		PGPKGAPGKP		GKPGEAGLPG		LPGVDGLTGR		DGPPGPKGAP
GERGSLGPPG		PPGLGGKGLP		GPPGEAGVSG		PPGGIGLRGP		PGPSGLPGLP
GPPGPPGPPG		HPGVLPEGAT		DLQCPSICPP		GPPGPPGMPG		FKGPTGYKGE
QGEVGKDGEK		GDPGPPGPAG		LPGSVGLQGP		RGLRGLPGPL		GPPGDRGPIG
FRGPPGIPGA		PGKAGDRGER		GPEGFRGPKG		DLGRPGPKGT		PGVAGPSGEP
GMPGKDGQNG		VPGLDGQKGE		AGRNGAPGEK		GPNGLPGLPG		RAGSKGEKGE
RGRAGELGEA		GPSGEPGVPG		DAGMPGERGE		AGHRGSAGAL		GPQGPPGAPG
VRGFQGQKGS		MGDPGLPGPQ		GLRGDVGDRG		PGGAAGPKGD		QGIAGSDGLP
GDKGELGPSG		LVGPKGESGS		RGELGPKGTQ		GPNGTSGVQG		VPGPPGPLGL
QGVPGVPGIT		GKPGVPGKEA		SEQRIRELCG		GMISEQIAQL		AAHLRKPLAP
GSIGRPGPAG		PPGPPGPPGS		IGHPGARGPP		GYRGPTGELG		DPGPRGNQGD
RGDKGAAGAG		LDGPEGDQGP		QGPQGVPGTS		KDGQDGAPGE		PGPPGDPGLP
GAIGAQGTPG		ICDTSACQGA		VLGGVGEKSG		SRSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Peraelae M., Savontaus M., Metsaeranta M., Vuorio E. (1997). Developmental regulation of mRNA species for types II, IX and XI collagens during mouse embryogenesis. Biochem. J. 324: 209—216. PMID 9164858 DOI:10.1042/bj3240209

Див. також

• Хромосома 20