CAPN10

CAPN10
Ідентифікатори
Символи	CAPN10, CANP10, NIDDM1, calpain 10
Зовнішні ІД	OMIM: 605286 MGI: 1344392 HomoloGene: 36323 GeneCards: CAPN10
Онтологія гена Молекулярна функція • cytoskeletal protein binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • SNARE binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • гіалоплазма • клітинна мембрана • мітохондрія • цитоплазма Біологічний процес • actin cytoskeleton reorganization • positive regulation of glucose import • cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis • positive regulation of intracellular transport • positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • протеоліз • positive regulation of insulin secretion • cellular response to insulin stimulus • type B pancreatic cell apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11132	23830
Ensembl	ENSG00000142330	ENSMUSG00000026270
UniProt	Q9HC96	Q9ESK3
RefSeq (мРНК)	NM_023089 NM_021251 NM_023083 NM_023084 NM_023085 NM_023086 NM_023087 NM_023088	NM_011796
RefSeq (білок)	NP_075571 NP_075573	NP_035926
Локус (UCSC)	Хр. 2: 240.59 – 240.62 Mb	Хр. 1: 92.86 – 92.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPN10 (англ. Calpain 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот, а молекулярна маса — 74 952.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRAGRGATPA		RELFRDAAFP		AADSSLFCDL		STPLAQFRED		ITWRRPQEIC
ATPRLFPDDP		REGQVKQGLL		GDCWFLCACA		ALQKSRHLLD		QVIPPGQPSW
ADQEYRGSFT		CRIWQFGRWV		EVTTDDRLPC		LAGRLCFSRC		QREDVFWLPL
LEKVYAKVHG		SYEHLWAGQV		ADALVDLTGG		LAERWNLKGV		AGSGGQQDRP
GRWEHRTCRQ		LLHLKDQCLI		SCCVLSPRAG		ARELGEFHAF		IVSDLRELQG
QAGQCILLLR		IQNPWGRRCW		QGLWREGGEG		WSQVDAAVAS		ELLSQLQEGE
FWVEEEEFLR		EFDELTVGYP		VTEAGHLQSL		YTERLLCHTR		ALPGAWVKGQ
SAGGCRNNSG		FPSNPKFWLR		VSEPSEVYIA		VLQRSRLHAA		DWAGRARALV
GDSHTSWSPA		SIPGKHYQAV		GLHLWKVEKR		RVNLPRVLSM		PPVAGTACHA
YDREVHLRCE		LSPGYYLAVP		STFLKDAPGE		FLLRVFSTGR		VSLSAIRAVA
KNTTPGAALP		AGEWGTVQLR		GSWRVGQTAG		GSRNFASYPT		NPCFPFSVPE
GPGPRCVRIT		LHQHCRPSDT		EFHPIGFHIF		QVPEGGRSQD		APPLLLQEPL
LSCVPHRYAQ		EVSRLCLLPA		GTYKVVPSTY		LPDTEGAFTV		TIATRIDRPS
IHSQEMLGQF		LQEVSIMAVM		KT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 doi:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Brown A.E., Yeaman S.J., Walker M. (2007). Targeted suppression of calpain-10 expression impairs insulin-stimulated glucose uptake in cultured primary human skeletal muscle cells. Mol. Genet. Metab. 91: 318—324. PMID 17572128 doi:10.1016/j.ymgme.2007.05.001

Див. також

• Хромосома 2