HCoV-OC43

Humant koronavirus OC43 (HCoV-OC43)^[1] tilhører arten Betacoronavirus 1 i slekten Betacoronavirus; det kan infisere mennesker og kveg.^[2]^[3]

Det infiserende koronaviruset er et innkapslet, enkeltstrenget (single-stranded) RNA-virus med positiv sense, som kommer inn i vertscellen ved å binde til reseptoren 'N-acetyl-9-O-acetylneuraminsyre'.^[4]

OC43 er et av syv kjente koronavirus (2021) som kan infisere mennesker: HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, MERS-CoV, det opprinnelige SARS-CoV (eller SARS-CoV-1) og SARS-CoV-2.

Sammen med HCoV-229E og HCoV-NL63 (medlemmer av Alphacoronavirus-slekten) og Betacoronavirus HCoV-HKU1 er det ett av de virus som er ansvarlige for forkjølelse.^[5]^[6] Viruset har − likesom andre koronavirus fra slekten Betacoronavirus, subgenus Embecovirus − ytterligere et kortere peplomer eller spike-protein^[7] Hemagglutinin esterase (HE).^[2]^[8]

Analyse av det molekylære ur mellom menneskets OC43-virus og kyrenes koronavirus (BCoV) viser et påfallende årstallssammenfall for virusenes seneste felles stamfar og 1889-1890-pandemien.^[9] Den pandemien har ellers vært forklart som en influensapandemi.

Referanser

^ Lee, Paul. Molecular epidemiology of human coronavirus OC43 in Hong Kong (thesis). The University of Hong Kong Libraries. doi:10.5353/th_b4501128.
^ ^a ^b «Taxonomy browser (Betacoronavirus 1)». www.ncbi.nlm.nih.gov. Besøkt 29. februar 2020.
^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang (25. juli 2016). «Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions». Diseases. 4 (3): 26. PMC 5456285 . PMID 28933406. doi:10.3390/diseases4030026. «See Table 1.»
^ Li, Fang (29. september 2016). «Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins». Annual Review of Virology. 3 (1): 237–261. PMC 5457962 . PMID 27578435. doi:10.1146/annurev-virology-110615-042301. «BCoV S1-NTD does not recognize galactose as galectins do. Instead, it recognizes 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminic acid (Neu5,9Ac2) (30, 43). The same sugar receptor is also recognized by human coronavirus OC43 (43, 99). OC43 and BCoV are closely related genetically, and OC43 might have resulted from zoonotic spillover of BCoV (100, 101).»
^ Lau, Susanna K. P.; Lee, Paul; Tsang, Alan K. L.; Yip, Cyril C. Y.; Tse, Herman; Lee, Rodney A.; So, Lok-Yee; Lau, Y.-L.; Chan, Kwok-Hung; Woo, Patrick C. Y.; Yuen, Kwok-Yung (2011). «Molecular Epidemiology of Human Coronavirus OC43 Reveals Evolution of Different Genotypes over Time and Recent Emergence of a Novel Genotype due to Natural Recombination». Journal of Virology. 85 (21): 11325–37. PMC 3194943 . PMID 21849456. doi:10.1128/JVI.05512-11.
^ Gaunt, E.R.; Hardie, A.; Claas, E.C.J.; Simmonds, P.; Templeton, K.E. (2010). «Epidemiology and clinical presentations of the four human coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 detected over 3 years using a novel multiplex real-time PCR method». J Clin Microbiol. 48 (8): 2940–7. PMC 2916580 . PMID 20554810. doi:10.1128/JCM.00636-10.
^ peplomer / spike-protein : Vedrørende strukturproteiner gjelder det for dette: «Spike (S) (også kalt peplomer) er overflateprotein og glycoprotein på 1255-1282 aminosyrer, som danner trimerer og bestemmer vertsspesifisiteten og infektiviteten, idet det reagerer med vertens cellulære recestor, ...»
^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (24. august 2010). «Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis». Viruses. 2 (8): 1804–20. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. «In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).»
^ Leen Vijgen; Els Keyaerts; Elien Moës; Inge Thoelen; Elke Wollants; Philippe Lemey; Anne-Mieke Vandamme; Marc Van Ranst (1. februar 2005). «Complete genomic sequence of human coronavirus OC43: molecular clock analysis suggests a relatively recent zoonotic coronavirus transmission event». Journal of Virology. 79 (3): 1595-1604. PMC 544107 . PMID 15650185. doi:10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005. Wikidata Q33717322.

Eksterne lenker

(en) Human coronavirus OC43 – kategori av bilder, video eller lyd på Commons
Wikispecies har taksonomi med forbindelse til Human coronavirus OC43
"Coronaviruses" fra Micro.msb.le.ac.uk
"Betacoronavirus" fra Viralzone.expasy.org

[1] Lee, Paul. Molecular epidemiology of human coronavirus OC43 in Hong Kong (thesis). The University of Hong Kong Libraries. doi:10.5353/th_b4501128.

[:0-2] «Taxonomy browser (Betacoronavirus 1)». www.ncbi.nlm.nih.gov. Besøkt 29. februar 2020.

[3] Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang (25. juli 2016). «Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions». Diseases. 4 (3): 26. PMC 5456285 . PMID 28933406. doi:10.3390/diseases4030026. «See Table 1.»

[4] Li, Fang (29. september 2016). «Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins». Annual Review of Virology. 3 (1): 237–261. PMC 5457962 . PMID 27578435. doi:10.1146/annurev-virology-110615-042301. «BCoV S1-NTD does not recognize galactose as galectins do. Instead, it recognizes 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminic acid (Neu5,9Ac2) (30, 43). The same sugar receptor is also recognized by human coronavirus OC43 (43, 99). OC43 and BCoV are closely related genetically, and OC43 might have resulted from zoonotic spillover of BCoV (100, 101).»

[DoiJVIMissing-5] Lau, Susanna K. P.; Lee, Paul; Tsang, Alan K. L.; Yip, Cyril C. Y.; Tse, Herman; Lee, Rodney A.; So, Lok-Yee; Lau, Y.-L.; Chan, Kwok-Hung; Woo, Patrick C. Y.; Yuen, Kwok-Yung (2011). «Molecular Epidemiology of Human Coronavirus OC43 Reveals Evolution of Different Genotypes over Time and Recent Emergence of a Novel Genotype due to Natural Recombination». Journal of Virology. 85 (21): 11325–37. PMC 3194943 . PMID 21849456. doi:10.1128/JVI.05512-11.

[6] Gaunt, E.R.; Hardie, A.; Claas, E.C.J.; Simmonds, P.; Templeton, K.E. (2010). «Epidemiology and clinical presentations of the four human coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 detected over 3 years using a novel multiplex real-time PCR method». J Clin Microbiol. 48 (8): 2940–7. PMC 2916580 . PMID 20554810. doi:10.1128/JCM.00636-10.

[7] peplomer / spike-protein : Vedrørende strukturproteiner gjelder det for dette: «Spike (S) (også kalt peplomer) er overflateprotein og glycoprotein på 1255-1282 aminosyrer, som danner trimerer og bestemmer vertsspesifisiteten og infektiviteten, idet det reagerer med vertens cellulære recestor, ...»

[:03-8] Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (24. august 2010). «Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis». Viruses. 2 (8): 1804–20. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. «In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).»

[9] Leen Vijgen; Els Keyaerts; Elien Moës; Inge Thoelen; Elke Wollants; Philippe Lemey; Anne-Mieke Vandamme; Marc Van Ranst (1. februar 2005). «Complete genomic sequence of human coronavirus OC43: molecular clock analysis suggests a relatively recent zoonotic coronavirus transmission event». Journal of Virology. 79 (3): 1595-1604. PMC 544107 . PMID 15650185. doi:10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005. Wikidata Q33717322.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]