まず、日本語の子音構造自体が根拠になります。 カ行音、タ行音、パ行音は、「破裂音」と呼ばれる種類の音で、 非常に多くの言語に備わっている基本的な音です。特にパ行音は ほとんどの言語に備わっています。しかし現代日本語では、擬態語や 外来語を除くと、促音の直後以外はほとんど現われません。これは、 ハ行がパ行音だったのに、発音の変化によりパ行音が失われたためです。 日本語では「清音」と「濁音」が対になっていて、「連濁」という現象では これが交替しますが、カ行とガ行、サ行とザ行、タ行とダ行では 同じ種類の子音の「無声音」と「有声音」（声帯を震わせるかどうか）が 対になっているのに、ハ行とバ行は全くそのような関係に なっていません。ハ行がかつてパ行だったと考えれば、 他の行と同様の関係が成り立ちます。 万葉仮名では、例えば「は」には「波」「半」、 「ひ」には「比」「卑」などの漢字が使われています。 これらの当時の漢字音はパ行音で始まる子音だったことが分かっており、 現在の北京音などでもパ行音やファ行音といった唇を使う音です。 当時や現代の中国語でハ行音を持つ漢字は、 中世までは日本語のハ行の表記には決して使われず、 中国語でハ行音を持った漢字は日本語ではカ行で受容されています。 例えば「上海」や「香港」の「海」（ハイ、かい）「香」（ホン、こう）などです。 これは、かつての日本語のハ行がパ行音またはファ行音だったために、 ハ行音に最も近い音を持つ行としてカ行が選ばれたからです。 中央語ではハ行がファ行音だった時代は17世紀までと言われています。 例えば16世紀には、ヨーロッパからキリスト教宣教師が来て、 日本語をラテン文字で記録しました。 この当時、日本語のハ行の表記にFが使われています。 例えば、「天草版平家物語」の表紙（検索すれば画像も出てきます）には、 ｢日本の言葉とイストリア（歴史）を習い知らんと欲する人の 為に世話に和げたる平家の物語｣ が、 「Nifon no cotoba to Historia uo narai xiran to fossuru fito no tameni xeua ni yavaraguetaru Feiqe no monogatari.」と書かれています。 また、当時のオランダの日本地図には、平戸がFirando、肥前がFigen、 博多がFacataなどと書かれています。具体的な発音も記述されていて、 ハ行の発音は「ラテン語のFとHの中間」などと書かれています。 これは、下唇と上の歯を近付けるラテン語のFと、両唇を近付ける 日本語のファ行音の違いを表したものでしょう。 同時期の中国語資料でも、日本語のハ行は 中国語でパ行音やファ行音を持った漢字で書き表されています。 また、1516年の『後奈良院御撰何曽』には、 「母には二度会ひたれど父には一度も会はず」という謎々があり、 答えは「唇」です。この当時、「母」の発音は「ファファ」「ファワ」であり、 ファ行音とワ行音は唇を丸めるため、このような謎々が成立したのです。 また、中国の音韻論では、発音方法により子音を五種類に分ける 「五音」がありましたが、この中でハ行はマ行、バ行とともに「唇音」とされました。 この分類は長い間使われてきましたが、1695年に作られた「新撰音韻之図」では、 ハ行の所属を「変喉」として改め、ア行とカ行の中間に置いています。 これは、江戸時代前期に、もはや中央語ではハ行の発音に唇を使わなくなり、 喉のほうで発音する現在のハ行音になっていたことをはっきりと示しています。 このように様々な証拠がありますが、 これら全てよりもはっきりとした証拠になるのは、 何といっても現在でも話されている日本語の方言です。 17世紀以前の中央語の状態、 すなわちハ行をファ行音で発音する状態を残す方言が、 東北方言や琉球方言の中に残っています。例えば秋田県の高齢者には、 「髭」を「フィゲ」、「蛇」を「フェビ」と発音する人がいますし、 「母にだば二度会うども、父にだば一度も会わねぁ、くじびら」という謎々が 残っていました。 そして驚くべきことに、琉球方言の一部には、ハ行をパ行音で発音する方言、 つまり中央語の7世紀以前の状態を残す方言が現存しています！ 例えば奄美方言では、 「花」は「パナ」、「人」は「ピトゥ」、「骨」は「プニ」と発音します。 琉球方言の中にはハ行がパ行音のもの、ファ行音のもの、 ハ行音のものが揃っています。 ハ行がパ行音→ファ行音→ハ行音へと変化したのは、 「唇音退化」と呼ばれる現象で、 唇を使う発音がだんだん唇を使わない発音へと変化していくものです。 他にも、語中のハ行がワ行に同化した「ハ行転呼」、 東日本で母音のウやワ行音の唇の丸めが弱いこと、 クヮのような合拗音の衰退も唇音退化で説明できます。 なお、唇音退化は様々な言語で起こっている普遍的な現象です。 アルメニア語では日本語のハ行音の変化と非常に似た変化が起こっていて、 印欧祖語のpが語頭でhになり、語中ではwになるか脱落しています。