pdist2を並列化 - Qiita

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pdist2を並列化 - Qiita

pdist2は，データ間のペアワイズ距離を計算してくれる便利関数です．ですが，Matlabプリセットのpdist2... pdist2は，データ間のペアワイズ距離を計算してくれる便利関数です．ですが，Matlabプリセットのpdist2はマルチコアでの並列化に対応してないので，データサイズがでかくなると計算時間がかかるという問題があります．そこで本記事では，データ並列化をすることで計算の高速化を目指します．statistic toolbox (pdist2), parallel computing toolbox (parfor) が必要ですのでご注意ください． function [ dmat ] = pdist2_parallel( X, Y, block_size, fun ) %PDIST2_PARALLEL parallelized version of pdist2 if(nargin<4) fun='euclidean'; % この辺はお好みで end % decompose similarit

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