祁秉忠(1573年—1622年),明朝官员,青海西宁人,祁世勋的儿子。
万历十九年(1591年),袭任指挥同知。万历四十四年(1616年)为永昌参将。蒙古的银定歹青率领二千余骑入塞,祁秉忠提兵三百抵御,转战两昼夜。援军到达,蒙古军退走。祁秉忠追还掠夺的人畜,边人称颂他。擢升为凉州副总兵,授平羌将军印。万历四十六年(1618年)应诏率士兵赴东北,以功晋升为提督蓟辽左都督。经略袁应泰以其智勇推荐他,令他率家丁守蒲河。后来辽阳已被后金所破,天启二年(1622年),朝廷命他为援剿总兵官,驻防闾阳,援西平,战死。